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标题: 求qsub同时提交多个作业 [打印本页]

作者: codeternity 时间: 2015-05-06 15:11
标题: 求qsub同时提交多个作业
各位大侠，小弟现在想用qsub提交作业。之前都是运行的一个软件，像下面这样

#!/bin/sh

#PBS -l walltim=50:00:00

cd /home/new/2

./treemix

现在需要同时运行这个软件10次或更多次，它们在不同的文件夹下，我以为像下面这样写就可以，可是不行，好像都还是只能运行一次。

#!/bin/sh

#PBS -l walltim=50:00:00

cd /home/new/2
./treemix

cd /home/new/3
./treemix

cd /home/new/4
./treemix
……

求大侠们指教，这种情况该怎么解决呢？？

作者: jason680 时间: 2015-05-06 15:32
本帖最后由 jason680 于 2015-05-06 15:35 编辑

回复 1# codeternity

remove the echo if you got the right answer

$ for n in `seq 2 12`
  do
echo cd /home/new/$n
echo ./treemix
      # ./treemix &    #<== for run all utilties(./treemix) at the same time
done
      # wait
cd /home/new/2
./treemix
cd /home/new/3
./treemix
cd /home/new/4
./treemix
cd /home/new/5
./treemix
cd /home/new/6
./treemix
cd /home/new/7
./treemix
cd /home/new/8
./treemix
cd /home/new/9
./treemix
cd /home/new/10
./treemix
cd /home/new/11
./treemix
cd /home/new/12
./treemix

作者: codeternity 时间: 2015-05-06 18:21
回复 2# jason680

大侠，貌似不行。不论去不去echo。我top一下，只有一个treemix在运行，并没有显示有2个在跑着。

而且那个$加上以后就不可以运行……

#!/bin/sh

#PBS -l walltime=60:00:00

$ for n in 'seq 2 3'
  do
echo cd /home/new/$n
echo ./treemix
      # ./treemix &    #<== for run all utilties(./treemix) at the same time
done
   #wait

cd /home/new/2
./treemix

cd /home/new/3
./treemix

是不是我运行的有问题？

作者: Herowinter 时间: 2015-05-06 18:47
本帖最后由 Herowinter 于 2015-05-06 18:49 编辑

回复 3# codeternity

那个代码是顺序执行的, 你要的是同时开始执行11几个?

作者: jason680 时间: 2015-05-06 19:26
回复 3# codeternity

shell基础二十篇
http://bbs.chinaunix.net/thread-452942-1-1.html

shell 十三問?
http://bbs.chinaunix.net/thread-218853-1-1.html

shell基础二十篇 shell基础三和四：后台(crontab,at,&,nohup)及(*,?,[]等)
http://bbs.chinaunix.net/thread-442596-1-1.html

作者: codeternity 时间: 2015-05-06 19:27
回复 4# Herowinter
对啊，我想的是同时把这几个一块运行，不是一个完了再运行下一个……
不知道有没有啥好办法……

作者: codeternity 时间: 2015-05-06 19:28
回复 5# jason680
好的，谢啦……

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