从事生物信息行业,主要工作语言是Python,主要用它来进行数据处理、分析、绘图,网站建设,系统管理,胶合各种应用搭建pipeline.
日常事务管理中,Python还是比较好用的,基本语言中没有遇到BUG,有些第三方包有些小问题,大多是系统环境配置问题,改改配置脚本就可以了,不行就谷歌**加联系作者,一般都能搞定。
多线程程序和多进程用的都不多,我的任务主要是因为pipeline搭建,主要用脚本连应用,并行化实在任务系统(OGE)中实现的。大数据系统,尝试过pySpark和HIVE的结合,所以Python本身的并行化就没必要了。
Python是易学易用的一门语言,比生物信息中另一种语言PERL要好很多。PHP用得不多,感觉它主要是做网站好,数据分析上很少人用。Java强大的类库支持是没法说的,但Python在粘合应用上功能似乎更好些。C++作为算法开发基础应用上有绝对速度优势。
在协同工作上,用过pyperl (可惜没有支持了)
Jython, Jpype 简单使用,经验不多
Pyrex也似乎过时了
网络项目一直在Windows上开发,Linux上发布,没有发现移植性问题,主要是一些配置不同,难度不大。
抱歉,工作中没有遇到类似问题,不便回答。
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