[已解决]求助如何用shell语言提取文本中的指定行并排序

popelrain

在/home/project/目录下有成千上万个文件夹，名称为PROJ00123542，PROJ34575140，和PROJ96541258.每个文件夹下都有一个与文件夹名称相同的txt文件PROJ00123542.txt,PROJ34575140.txt,PROJ96541258.txt等等

即目录为
/home/project/PROJ00123542/PROJ00123542.txt
/home/project/PROJ34575140/PROJ34575140.txt
/home/project/PROJ96541258/PROJ96541258.txt
等等

每个txt文件加下有这样的东东

PROJ00123542.txt
numb |   dppinity | zxcv from best numb
         | (kcal/mol) | rmsd l.b.| rmsd u.b.
-----+------------+----------+----------
   1         -10.7      0.000      0.000
   2         -9.1      1.478      3.519

PROJ34575140.txt
numb |   dppinity | zxcv from best numb
         | (kcal/mol) | rmsd l.b.| rmsd u.b.
-----+------------+----------+----------
   1         -8.1      0.000      0.000
   2         -7.2      1.128      3.319

PROJ96541258.txt
numb |   dppinity | zxcv from best numb
         | (kcal/mol) | rmsd l.b.| rmsd u.b.
-----+------------+----------+----------
   1         -9.2      0.000      0.000
   2         -6.4      1.458      3.259

要求提取每个txt文件中1所在行的dppinity(kcal/mol)数据（该数据都为负值），并讲dppinity(kcal/mol)数据之前的1修改为文件名，并按照dppinity(kcal/mol)数据的绝对值从大到小排序，输出到新的txt文件中，最终结果如下。

numb                 dppinity(kcal/mol)
PROJ00123542               -10.7
PROJ96541258                -9.2
PROJ34575140                -8.1

期待高手的出马。。。

asdf2110

1. find . -name "*.txt" | xargs awk '{if ($1=="1"){print FILENAME"\t"$2}}' | sort -nk2

复制代码

yestreenstars

1. [root@localhost ~]# find /home/project/
   
2. /home/project/
   
3. /home/project/PROJ96541258
   
4. /home/project/PROJ96541258/PROJ96541258.txt
   
5. /home/project/PROJ34575140
   
6. /home/project/PROJ34575140/PROJ34575140.txt
   
7. /home/project/PROJ00123542
   
8. /home/project/PROJ00123542/PROJ00123542.txt
   
9. [root@localhost ~]# find /home/project/ -type f -exec awk 'FNR==4{t=gensub(/.*\/(.*).txt$/,"\\1",1,FILENAME);print t,$2 | "sort -k2n"}' {} > newfile.txt +
   
10. [root@localhost ~]# cat newfile.txt
    
11. PROJ00123542 -10.7
    
12. PROJ96541258 -9.2
    
13. PROJ34575140 -8.1
    
14. [root@localhost ~]#

复制代码

popelrain

回复 2# asdf2110

谢谢，脚本很好。我将其修改修改输出到文本result中


echo           numb                 dppinity(kcal/mol) >>result 2>&1
find . -name "*.txt" | xargs awk '{if ($1=="1"){print FILENAME"\t"$2}}' | sort -nk2 >>result 2>&1

最终的结构显示：

          numb                 dppinity(kcal/mol)
./PROJ00123542/PROJ00123542.txt               -10.7
./PROJ96541258/PROJ96541258.txt                -9.2
./PROJ34575140/PROJ34575140.txt                -8.1

能否讲显示修改为：

          numb                 dppinity(kcal/mol)
PROJ00123542             -10.7
PROJ96541258               -9.2
PROJ34575140               -8.1
谢谢！

jason680

回复 4# popelrain

xargs awk '{if ($1=="1"){print FILENAME"\t"$2}}'

change to

xargs awk '$1==1{if(F!=FILENAME){f=F=FILENAME;gsub(/.*\//,"",f)};print f"\t"$2}'
   

b4and5

1. awk 'FNR==4{print FILENAME"\t\t"$2 | "sort -k2n"}'  project/*/*.txt | awk 'BEGIN{print "numb\t\t\tdppinity(kcal/mol)";FS="/"}{print $3}'

复制代码

popelrain

回复 5# jason680
非常感谢。

echo           numb                 dppinity(kcal/mol) >>result 2>&1
find . -name "*.txt" | xargs awk '$1==1{if(F!=FILENAME){f=F=FILENAME;gsub(/.*\//,"",f)};print f"\t"$2}' | sort -nk2 >>result 2>&1


结果显示为：

          numb                 dppinity(kcal/mol)
PROJ00123542.txt               -10.7
PROJ96541258.txt                -9.2
PROJ34575140.txt                -8.1




能否讲显示修改为（即将txt去掉）：

          numb                 dppinity(kcal/mol)
PROJ00123542             -10.7
PROJ96541258               -9.2
PROJ34575140               -8.1

   

jason680

回复 7# popelrain

add below to remove ".txt"

gsub(/\.txt$/,"",f)
   

popelrain

回复 8# jason680
添加上好像不管用啊？

   

popelrain

回复 6# b4and5

谢谢，辛苦了！

提示找不到awk: cannot open project/*/*.txt  (No such file or directory)