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模式匹配问题 [复制链接]

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天秤座
日期:2014-02-20 08:24:30
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1 [收藏(0)] [报告]
发表于 2014-02-19 13:05 |只看该作者 |倒序浏览
my $a=ATCGGAGGGATCATCATCGGCAGCCTGTG;
if($a=~/(([ATGC][ATGC][ATGC]){3})/)
{
   print $1."\n"
}

大家好,我的目的是匹配出红色部分,这样的结果是ATCGGAGGG。如果要匹配出红色部分,该怎么写模式匹配。

我是想拿出序列中连续出现三个ATC或者TAC或者AAA或者CCC,总之有64种组合。

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发表于 2014-02-19 13:09 |只看该作者
本帖最后由 afukada 于 2014-02-19 13:10 编辑

你是想要

ATCATCATC
TACTACTAC
AAAAAAAAA
CCCCCCCCC

這四種情形而已嗎?

還是ATCTACAAA這種也算

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天秤座
日期:2014-02-20 08:24:30
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发表于 2014-02-19 13:14 |只看该作者
想要
ATCATCATC
TACTACTAC
AAAAAAAAA
CCCCCCCCC
但是有64种

ATCTACAAA不要,就是程序写错了出现了下面的结果

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发表于 2014-02-19 13:25 |只看该作者
本帖最后由 afukada 于 2014-02-19 13:26 编辑

我看懂你要什麼了@@

這個應該是你要的
  1. $a="ATCGGAGGGATCATCATCGGCAGCCTGTG";

  2. if($a=~/(([ATGC]{3})\2\2)/)
  3. {
  4.         print $1,"\n";
  5. }
复制代码

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丑牛
日期:2014-01-21 08:26:26卯兔
日期:2014-03-11 06:37:43天秤座
日期:2014-03-25 08:52:52寅虎
日期:2014-04-19 11:39:48午马
日期:2014-08-06 03:56:58
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发表于 2014-02-19 13:35 |只看该作者
  1. my $a      = 'ATCGGAGGGATCATCATCGGCAGCCTGTG';
  2. my $begin  = 3 * 3;
  3. my $length = 9;
  4. print substr $a, $begin, $length;
复制代码

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天秤座
日期:2014-02-20 08:24:30
6 [报告]
发表于 2014-02-19 13:53 |只看该作者
回复 4# afukada
太厉害了,完全正确,非常感谢,好人啊。

   

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CU十二周年纪念徽章
日期:2013-10-24 15:41:34
7 [报告]
发表于 2014-02-19 14:32 |只看该作者
回复 4# afukada


    楼主说的我没看懂,你这倒是比他说的明白
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