免费注册 查看新帖 |

Chinaunix

  平台 论坛 博客 文库
最近访问板块 发新帖
查看: 735 | 回复: 7
打印 上一主题 下一主题

[文本处理] 想请教各路英雄一个循环语句 [复制链接]

论坛徽章:
0
跳转到指定楼层
1 [收藏(0)] [报告]
发表于 2016-09-05 15:59 |只看该作者 |倒序浏览
事情是这样子的,有点复杂,新手上路,请各路大神能够伸手相助,O(∩_∩)O谢谢
文件夹路径:/for_test/
子文件:
PPIG
PCBP2
NPM1
NONO
NCBP2
LSM11
LIN28B

每个子文件夹里有一个或者两个子文件夹,分布名为 HepG2 或者 K562 (注:这边文件夹的名字固定,但就是有的文件下面只有其中一个文件夹,有的有两个)

然后我想做这样的处理无论是一个或者两个子文件夹,都cd 进入,
然后对里面的两个压缩文件 .bed.gz 的文件用gunzip -c 进行解压为 .bed (注,这边除了 .bed.gz 文件还有另外其他的文件)

实际上有70个文件夹,所以我想寻求一个循环语句完成·····

论坛徽章:
145
技术图书徽章
日期:2013-10-01 15:32:13戌狗
日期:2013-10-25 13:31:35金牛座
日期:2013-11-04 16:22:07子鼠
日期:2013-11-18 18:48:57白羊座
日期:2013-11-29 10:09:11狮子座
日期:2013-12-12 09:57:42白羊座
日期:2013-12-24 16:24:46辰龙
日期:2014-01-08 15:26:12技术图书徽章
日期:2014-01-17 13:24:40巳蛇
日期:2014-02-18 14:32:59未羊
日期:2014-02-20 14:12:13白羊座
日期:2014-02-26 12:06:59
2 [报告]
发表于 2016-09-05 16:18 |只看该作者
1. find
2. gunzip

论坛徽章:
28
15-16赛季CBA联赛之八一
日期:2016-02-22 19:10:4215-16赛季CBA联赛之深圳
日期:2016-12-01 10:34:0415-16赛季CBA联赛之新疆
日期:2016-12-07 10:24:2915-16赛季CBA联赛之同曦
日期:2016-12-15 12:06:43CU十四周年纪念徽章
日期:2016-12-18 13:03:4415-16赛季CBA联赛之吉林
日期:2017-01-03 15:52:2515-16赛季CBA联赛之辽宁
日期:2017-01-04 14:58:2415-16赛季CBA联赛之辽宁
日期:2017-01-15 09:42:512016科比退役纪念章
日期:2017-02-06 17:21:50黑曼巴
日期:2017-02-10 15:46:1215-16赛季CBA联赛之上海
日期:2017-03-18 10:14:5415-16赛季CBA联赛之青岛
日期:2017-03-18 22:00:44
3 [报告]
发表于 2016-09-05 16:45 |只看该作者

  1. find /for_test/PPIG -type f -name "*.bed.gz"|xargs gunzip
复制代码

?

论坛徽章:
0
4 [报告]
发表于 2016-09-05 21:17 |只看该作者
回复 3# moperyblue 谢谢您


论坛徽章:
0
5 [报告]
发表于 2016-09-05 21:17 |只看该作者
回复 2# jason680 谢谢您


论坛徽章:
0
6 [报告]
发表于 2016-09-05 21:58 |只看该作者
回复 3# moperyblue 这位大神,代码我跑过了,挺好的,但是能不能保留原始文件呢,用gunzip的时候,我加了-c,但是好像不行


论坛徽章:
28
15-16赛季CBA联赛之八一
日期:2016-02-22 19:10:4215-16赛季CBA联赛之深圳
日期:2016-12-01 10:34:0415-16赛季CBA联赛之新疆
日期:2016-12-07 10:24:2915-16赛季CBA联赛之同曦
日期:2016-12-15 12:06:43CU十四周年纪念徽章
日期:2016-12-18 13:03:4415-16赛季CBA联赛之吉林
日期:2017-01-03 15:52:2515-16赛季CBA联赛之辽宁
日期:2017-01-04 14:58:2415-16赛季CBA联赛之辽宁
日期:2017-01-15 09:42:512016科比退役纪念章
日期:2017-02-06 17:21:50黑曼巴
日期:2017-02-10 15:46:1215-16赛季CBA联赛之上海
日期:2017-03-18 10:14:5415-16赛季CBA联赛之青岛
日期:2017-03-18 22:00:44
7 [报告]
发表于 2016-09-05 22:36 |只看该作者
本帖最后由 moperyblue 于 2016-09-06 08:59 编辑

回复 6# 蓝色未央


man gunzip
  1. find /for_test/PPIG -type f -name "*.bed.gz"|sed -nr 's/(.*)(.gz)/gunzip -c & > \1/e'
复制代码
  1. find /for_test/PPIG -type f -name "*.bed.gz"|sed 's/.*/gunzip -c & > &/;s/.gz//2'|sh
复制代码
  1. for i in `find /for_test/PPIG -type f -name "*.bed.gz"`;do gunzip -c $i > ${i%.gz} ;done
复制代码

论坛徽章:
0
8 [报告]
发表于 2016-09-07 22:35 |只看该作者
回复 7# moperyblue

O(∩_∩)O谢谢大神多次出手相助
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则 发表回复

  

北京盛拓优讯信息技术有限公司. 版权所有 京ICP备16024965号-6 北京市公安局海淀分局网监中心备案编号:11010802020122 niuxiaotong@pcpop.com 17352615567
未成年举报专区
中国互联网协会会员  联系我们:huangweiwei@itpub.net
感谢所有关心和支持过ChinaUnix的朋友们 转载本站内容请注明原作者名及出处

清除 Cookies - ChinaUnix - Archiver - WAP - TOP