笔者是北京生命科学研究所，黄牛博士实验室的工程师。日常工作是管理计算机集群系统。这次有偶然的机会，参加了ChinaUnix论坛上的ThinkPadW系列的试用活动。
我们实验室是一个以生命基础科学研究为主的实验室，主要研究方向是蛋白质和小分子的相互作用，以及蛋白质的分子动力学模拟。经常需要使用3D软件来查看结果。显卡的3D性能，尤其是OpenGL的性能表现，是我们这个行业的用户最为关心的。
笔者这次试用的ThinkpadW510系列中的4319A17型号，这是目前在Thinkpad系列中属于高端的移动工作站。配备了主频为1.6G的Intel四核酷睿i7 720QM处理器，标配3G内存。500G高速硬盘。带1G显存的NvidiaQuadro FX 880M 显卡。其他配置还有wifi、蓝牙、内置摄像头、读卡器、键盘灯、指纹识别等。
从下面的这张图片我们可以清晰地看出，新版的W510全新预祝的是Windows7操作系统，能够更好地发挥硬件的性能：
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另外，因为是工作站系列，我们可以清晰地从键盘布局看出这款笔记本和ThinkPad其他系列笔记本电脑的不同之处，但是经典的红点指点杆还是非常醒目。
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整机重量为2.57千克。对于移动工作站级别的电脑来说，这么轻的重量以及很不容易了。下面是一张工作中的图片。
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机器外形仍然是Thinkpad的一贯作风，只是作为一款移动工作站，体积和重量明显比其他系列的Thinkpad要厚、重。属于一看就感觉经久耐用的类型。
我们实验室的工作人员经常使用UCSF（美国加州大学旧金山分校）开发的Chimera软件以及UIUC(伊利诺大学香槟分校)开发的VMD软件。
这两款软件都支持OpenGL，支持立体眼镜。特别要指出的是，VMD软件还支持Nvidia 风靡全球科学界的CUDA GPU加速功能。由于对显卡要求很高，两款软件在普通台式电脑上都无法流畅运行，笔记本电脑上当然就更寸步难行了。Thinkpad W510移动工作站由于使用了专业级别的NVIDIA Quadro FX 880M显卡，使得OpenGL性能有了质的飞跃，图形渲染加速很完美，如何如何转动和拖移立体蛋白结构图，都很流畅。
用上了Thinkpad W510移动工作站，可以说立刻烦恼告别。下图是一张UCSF Chimera软件的效果图。图中显示了一个蛋白激酶(Kinase)和一个小分子相互作用的构象（形态）。图中可以清楚的看到作用位点。
使用3D眼镜模式，在普通显卡上渲染类似的结果，时间很长。而使用了Thinkpad W510移动工作站，工作效率立刻成倍增长。
日常使用Gromacs/NMAD或Desmond进行分子动力学模拟，作为计算结果的一部分，是一段蛋白质运动的轨迹图，简单的说就是一部电影，显示了蛋白质在水溶液中的运动情况。通常模拟一个蛋白时要用7-20万的水分子。这直接导致了查看结果时计算机渲染的极度困难。
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上图显示了一个跨膜蛋白的在水溶液中的形态，上下的红白相间的小点是水分子。中间是蛋白。令爱注意右侧偏上的部分，有一个小分子化合物。
在普通显卡，甚至是相当不错的3D显卡上，渲染一个和上图类似的1分钟动画，可能需要20多分钟才能播放完毕，令人难以忍受。由于Thinkpad W510内置的NVIDIA Quadro FX 880M支持CUDA GPU
加速，速度提高达20倍以上！
除了显卡强劲之外，Thinkpad W510的硬盘容量大、速度快，内置摄像头也效果上佳，内置蓝牙和Wifi功能使得和手机等数码产品能方便的连接，总而言之，Thinkpad W510移动工作站，绝对是科研人员的利器。反正我是非常喜欢的哈，如果价格合适，所里有预算，我也会买一台！
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发表于 2010-11-09 18:06
发表于 2010-11-18 14:19
