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标题: 如何判断A文件数值是否在B文件的数值区间之中 [打印本页]

作者: chenjiali1 时间: 2013-10-15 13:51
标题: 如何判断A文件数值是否在B文件的数值区间之中
大家好，我有两个文件，分别如下：
A文件：
chr1 2
chr1 72
chr3 42
chr4 12

B文件
chr1 1       2
chr1 72       275
chr3 25       50
chr4 6       10
如果A文件中的第二列处于B文件的某行的2,3列数字之间（当然第一列要是一致的），把这些行合并输出，结果如下
chr1 2    chr1 1       2
chr1 72 chr1 72       275
chr3 42 chr3 25       50

请问用awk如何实现，我自己写的老是提示语法错误，谢谢大家。

作者: Shell_HAT 时间: 2013-10-15 13:55
把你写的贴出来看看

作者: yestreenstars 时间: 2013-10-15 13:58
本帖最后由 yestreenstars 于 2013-10-15 14:17 编辑

如果两个文件是对应的话：

[root@localhost ~]# awk 'NR==FNR{a[NR]=$2;b[NR]=$0;next}a[FNR]>=$2&&a[FNR]<=$3{print b[FNR]"\t"$0}' a b
chr1 2 chr1 1 2
chr1 72 chr1 72 275
chr3 42 chr3 25 50
[root@localhost ~]#

复制代码

作者: 关阴月飞 时间: 2013-10-15 14:10
回复 1# chenjiali1

awk 'FNR==NR{a[$1]++;b[$1,a[$1]]=$2;next}{for(i=1;i<=a[$1];i++)if(b[$1,i]>=$2 && b[$1,i]<=$3)print $1,b[$1,i],$0}' a b

复制代码

作者: li0924 时间: 2013-10-15 14:13

awk 'NR==FNR{a[$1,FNR]=$0;b[$1,FNR]=$2;next}{if(a[$1,FNR]){if(b[$1,FNR]>=$2 && b[$1,FNR]<=$3)print a[$1,FNR],$0}}' A B

复制代码

作者: WilliBhamlll 时间: 2013-10-15 14:31

awk 'NR==FNR{a[++i]=$2;next}a[FNR]>=$2&&a[FNR]<=$3{print $1"\t"a[FNR]"\t"$0}' a b

复制代码

作者: chenjiali1 时间: 2013-10-15 14:42
非常感谢大家

作者: elu_ligao 时间: 2013-10-15 15:03
awk 'NR==FNR{a[++i]=$1; b[++j]=$2; next}a[FNR]==$1&&b[FNR]>=$2&&b[FNR]<=$3{print a[FNR]"\t"b[FNR]"\t"$0}' A B

作者: LikeLx 时间: 2013-10-15 15:58
回复 4# 关阴月飞
又学习了一种思路

作者: expert1 时间: 2013-10-15 16:50
回复 1# chenjiali1

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