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标题: 如何提取特定符号行中的关键字并输出随后几行 [打印本页]

作者: tingshuibanxia 时间: 2016-07-25 11:46
标题: 如何提取特定符号行中的关键字并输出随后几行
请教大家，例如有文件A是这样：

>H1_22 ASDSF AA BB 1111
ASDSJFKJKDJF
DSJFKDJFDJDFDFD
>F2_44_3 SDKS BB DF 2323
DFDSFDDGJFGLJFLDL
>SDS_22 DFD AA FDD 1111
FDSFDSFDGDG
FDFDSFDGFDGTHTYU
FDGRFHHHHHHHHHH
.......

如何将以>号开头的行中第3列为AA的行以及随后的几行提取出来？
生成这样：
>H1_22 ASDSF AA BB 1111
ASDSJFKJKDJF
DSJFKDJFDJDFDFD
>SDS_22 DFD AA FDD 1111
FDSFDSFDGDG
FDFDSFDGFDGTHTYU
FDGRFHHHHHHHHHH

作者: elu_ligao 时间: 2016-07-25 11:58

awk '/>/{f=$3=="AA"?1:0}f'

复制代码

作者: tingshuibanxia 时间: 2016-07-25 12:02
回复 2# elu_ligao

谢谢，请问？1:0如何理解？

作者: moperyblue 时间: 2016-07-25 12:12
本帖最后由 moperyblue 于 2016-08-05 22:25 编辑

awk -vRS='>' '$3=="AA"{printf RS $0}'
awk '/^>/{f=$3=="AA"}f'
grep -oPz '>(\S+\s+){2}AA [^>]*'|awk NF
sed '/>/i \\'|sed -r '/^>(\S+\s+){2}AA\s/{:a;N;/\n$/!{$!ba};s/\n$//;p};d'
sed -r ':b;/^>(\S+\s+){2}AA\s/{:a;N;/\n>/!{$q;ba};h;s/(.*)\n(.*)/\1/p;g;s//\2/;bb};d'

复制代码

作者: sunzhiguolu 时间: 2016-07-25 13:05

perl -ane 'if(/>/){print if($P=$F[2] eq "AA" ? 1 : 0);next}print if($P)' f

复制代码

>H1_22 ASDSF AA BB 1111
ASDSJFKJKDJF
DSJFKDJFDJDFDFD
>SDS_22 DFD AA FDD 1111
FDSFDSFDGDG
FDFDSFDGFDGTHTYU
FDGRFHHHHHHHHHH

作者: Herowinter 时间: 2016-07-25 13:53
回复 3# tingshuibanxia

http://baike.baidu.com/link?url=fqmORbuZS4ZF9quGfaEFyrBEj7b5dNCwnHU1dAcLcA5rCM8ak-z73KwG5_NO-Rhx-ETfFrcLANzBAioebCbFma

作者: ll104567 时间: 2016-07-25 14:13
awk '/>/{if($3=="AA"){a=1}else{a=0}}a'
给你翻译一下那个三目运算- -
顺手摸一下5楼pp
=================================防摸pp隔离带=======================================

作者: sunzhiguolu 时间: 2016-07-25 14:59

作者: 99超人 时间: 2016-07-25 15:07
提示: 作者被禁止或删除内容自动屏蔽

作者: 请叫我俊哥哈 时间: 2016-07-25 15:58
回复 4# moperyblue

我想请问下，你的第三个代码，就是当匹配到/\n>/，然后保存到保存空间，然后这里的替换 s/(.*)\n(.*)/\1/

是
>H1_22 ASDSF AA BB 1111
ASDSJFKJKDJF
DSJFKDJFDJDFDFD
>F2_44_3 SDKS BB DF 2323

替换成这个吗？
>H1_22 ASDSF AA BB 1111
ASDSJFKJKDJF
DSJFKDJFDJDFDFD

作者: moperyblue 时间: 2016-07-25 16:02
回复 10# 请叫我俊哥哈

对

作者: 我叫萌萌 时间: 2016-07-25 17:35
本帖最后由我叫萌萌于 2016-07-25 17:36 编辑

sed -n '/AA/,+1p' +1p 1 代表着你的输出后几行

作者: jcdiy0601 时间: 2016-07-26 09:26

awk 'BEGIN{RS=">"}{if($3=="AA")printf RS $0}' file

复制代码

作者: feiyu2994 时间: 2016-07-26 12:42
学习了，感谢分享

作者: OS_unix 时间: 2016-07-26 12:55

grep -oPz '>.*AA[^>]+(?=\n)'

复制代码

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