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标题: 确定文件是否为fastq格式 [打印本页]

作者: Quinta11 时间: 2017-05-12 10:05
标题: 确定文件是否为fastq格式
perl新手求各位大神指导，谢谢！问题是这样的：
读取input.txt文件，如果不符合fastq格式，输出不符合格式要求的行数。

input.txt文件的部分数据为：

@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1117:14185#0/1
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1117:14185#0/1
__`f__caY[\_]Z_`]ZZZ_]]]Z_Z_ZZ__V\
@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1161:14177#0/1
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1161:14177#0/1
BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1193:14175#0/1
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1193:14175#0/1
BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1227:14171#0/1
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1227:14171#0/1
@BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1257:12697#0/1
AAAAAAAAAGAAAAAAGGAAAAGAGGAGGTAATG
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1257:12697#0/1
BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

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