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straw

使用rocks或者OSCAR要看你心情了，我是自己做disk image的，也很方便。
关于分区，现在你对你的计算节点磁盘使用情况不明确的情况下，先用LVM，这样便于你方便的调整/tmp空间
关于任务调度分配，SGE可以实现你需求的各种队列，你可以把你的不同性质的任务递交给不同的队列
根据你的计算情况，在可能的情况下，尽量使用local disk
经常察看你的集群的各方面的状态数据，做些调整，呵呵

straw

选择什么样的机器和计算类型以及你对计算结果需要多久出来也有一定关系.最好拿自己的程序在不同的环境下跑一下得到一个大概的映像（只能作参考，不同的OS版本，kernel版本，运行库对计算速度都有影响）。
不过呢，追求计算速度也和你们对计算的需求有关系。比如，有的计算，只要求一天的运算对付一天产生的数据，而有的任务，后面等着好多人在崔。这个时候考虑的因素也就不一样了。各种因素都照顾到了也就行了，呵呵。
网络文件系统能少用的话就尽量少用，特别是自己写的程序，否则的话，单独规划一个网络，做些优化