免费注册 查看新帖 |

Chinaunix

  平台 论坛 博客 文库
最近访问板块 发新帖
查看: 5228 | 回复: 2
打印 上一主题 下一主题

求个一个perl程序,提取GO注释库里提取相应基因的GO号(求高手) [复制链接]

论坛徽章:
0
跳转到指定楼层
1 [收藏(0)] [报告]
发表于 2011-05-08 20:58 |显示全部楼层 |倒序浏览
5可用积分
本帖最后由 aids260 于 2011-05-08 20:59 编辑

BGIBMGA004936-PA        GO:0005085        GO:0005622        GO:0051056        GO:0005515        GO:0007165        GO:0007264
BGIBMGA005113-PA        GO:0008152        GO:0008415                               
BGIBMGA011416-PA        GO:0003735        GO:0005622        GO:0005840        GO:0006412               
BGIBMGA006470-PA        GO:0016491                                       
BGIBMGA000219-PA        GO:0005622        GO:0043565                               
BGIBMGA012457-PA        GO:0004984        GO:0005549        GO:0007608        GO:0016020               
BGIBMGA006942-PA        GO:0003676        GO:0005622        GO:0008270                       
BGIBMGA012123-PA        GO:0003824        GO:0008152                               
BGIBMGA001976-PA        GO:0018149                                       
BGIBMGA010922-PA        GO:0016021                                       
BGIBMGA008727-PA        GO:0005509        GO:0003824        GO:0008152                       
BGIBMGA009945-PA        GO:0003676        GO:0005622        GO:0008270        GO:0005524        GO:0016887       
BGIBMGA006678-PA        GO:0003676        GO:0005622        GO:0008270        GO:0003735        GO:0005840        GO:0006412
BGIBMGA010701-PA        GO:0006812        GO:0008324        GO:0016020                       
BGIBMGA008436-PA        GO:0003779        GO:0017048        GO:0030036        GO:0016043               
BGIBMGA008910-PA        GO:0004180        GO:0006508        GO:0004182




以上是我的GO 库的数据格式

我如果有以下这些基因名,就把GO库的相应信息提取出来,如果GO库里没有相应的基因名,就直接为空就可以(比如说BGIBMGA012345-PA)!

BGIBMGA006942-PA                
BGIBMGA012123-PA                        
BGIBMGA001976-PA                        
BGIBMGA010922-PA          
BGIBMGA009945-PA         
BGIBMGA012345-PA


提取的GO 号
BGIBMGA006942-PA        GO:0003676        GO:0005622        GO:0008270                       
BGIBMGA012123-PA        GO:0003824        GO:0008152                               
BGIBMGA001976-PA        GO:0018149                                       
BGIBMGA010922-PA        GO:0016021                                       
BGIBMGA009945-PA        GO:0003676        GO:0005622        GO:0008270        GO:0005524        GO:0016887       
BGIBMGA012345-PA

论坛徽章:
0
2 [报告]
发表于 2011-05-08 21:13 |显示全部楼层
顶一个!

论坛徽章:
0
3 [报告]
发表于 2011-05-08 21:15 |显示全部楼层
求高手速来围观啊
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则 发表回复

  

北京盛拓优讯信息技术有限公司. 版权所有 京ICP备16024965号-6 北京市公安局海淀分局网监中心备案编号:11010802020122 niuxiaotong@pcpop.com 17352615567
未成年举报专区
中国互联网协会会员  联系我们:huangweiwei@itpub.net
感谢所有关心和支持过ChinaUnix的朋友们 转载本站内容请注明原作者名及出处

清除 Cookies - ChinaUnix - Archiver - WAP - TOP