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谁能提供几个关于perl 生物基因方面的经典案例啊? [复制链接]

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发表于 2011-09-16 11:29 |显示全部楼层
不知道楼主具体是想考察哪一方面的内容,如果是生物方面,zhlong8的建议就差不多了,如果是perl在生物学或者生物信息学中的应用,主要的就是bioperl,另外,由perl完成的项目,如chado bioinformatics database schema,gbrowse genome browser等等。

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发表于 2011-09-16 23:23 |显示全部楼层
本帖最后由 longbow0 于 2011-09-16 23:47 编辑

Perl在生物方面的应用主要就是BioPerl。

比如怎样用bioperl解析GenBank文件,解析BLAST结果等等,都是非常常见的应用方面。

还可以看看这两本书:Beginning Perl for Bioinformatics 和 Mastering Perl for Bioinformatics,不过内容比较早。

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发表于 2011-09-18 05:15 |显示全部楼层
我的做法是,先用EMBOSS needle作两条序列的全局比对,然后再按需求用BioPerl选择或分析感兴趣的位点。
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