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楼主: huang6894
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【问题】对N个相似文本进行计算分析?5000积分求解决~ [复制链接]

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发表于 2014-08-11 16:24 |显示全部楼层
本帖最后由 xiumu2280 于 2014-08-11 16:27 编辑

生信的表示看懂了

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发表于 2014-08-11 16:31 |显示全部楼层
本帖最后由 xiumu2280 于 2014-08-11 16:31 编辑

他们的单行‘Region ****’都是一样的, #两行为一个单位,第一行相当于一个ID,chr1 21 33,表示在chr1上21到33的位置,下面第二行是对应在21到33位置上碱基的质量值也就是每个点的P值。
但是双行(双行表示region行最后两个数字之间每个点的质量值)是不同的,
我现在需要把这N个文件每个点的质量值取平均, #按照位置在多个文件内来个交叉求和再算平均值,这个平均值就是Q值。
每个点的质量值(P)都与这个平均值(Q)做比较, #即用P/Q
如果P值位于0~0.3Q之间,该点定义为flag1,如果P值位于0.3Q~0.6Q之间,定义改点为flag2,否则为flag3.(不会啊~)

最难的是:只有在连续5个点中有3个以上相同的flag时,认为该flag可信, #就是连续的5个位置中有3个以上在相同的flag区域,则输出该区域
输出这5个点的区域和flag,如chr1 2-6  flag1

我来帮你解释一下回复 3# pitonas


   

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发表于 2014-08-11 16:35 |显示全部楼层
能看懂问题,我感到很开心 {:2_168:} 回复 7# huang6894


   

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发表于 2014-08-11 16:49 |显示全部楼层
想了一下,哈希切片简直就是为这个问题准备的·····
看看晚上帮你写下回复 7# huang6894


   

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发表于 2014-08-11 20:42 |显示全部楼层
不是5个一组嘛  
3.txt    chr1  1-11  flag1
3.txt    chr1  1-11  flag3
又是什么意思

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发表于 2014-08-12 14:26 |显示全部楼层
昨天看的解释,和今天看的解释,完全是2种不同的情况。
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