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Chinaunix

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动态

2016-07-28

  • pony2001mx 发表了新话题 2016-07-28 09:28
    关于一个shell命令的问题
    大家好： 我有一个文件如下（第一列是gene ID， 第二列是值）。我需要设定不同的阈值，比如1,2,3,4,5，把基因归类, 产生不同文件。 gene1 3 gene2 4 g ...

2016-07-21

2015-11-14

  • pony2001mx 发表了新话题 2015-11-14 21:28
    按钮的动作（javascript）
    大家好： 我是HTML的初学者，写了如下代码。有两个下拉框：班级和人员。 我想做的是：点击“名字列表”这个按钮时，弹出对话框，提示用户是否下载文件。 比如选 ...

2015-07-08

  • pony2001mx 发表了新话题 2015-07-08 09:26
    语句中单个&是什么意思
    大家好： 有一个脚本有如下语句，我不明白第一句中&是什么意思，请指点迷津，非常谢谢！ $flag = $data[1]&64; if ($flag==0){ ... }

2015-06-28

2015-06-27

2015-06-22

2015-06-20

2015-05-31

2015-05-30

2015-04-25

2015-01-21

  • pony2001mx 发表了新话题 2015-01-21 17:21
    数组的数组
    大家好： 我有一个array的array，想输出所有组合，有些困惑，请高人指点，非常谢谢！理想的输出结果是： a1 b1 c1 a1 b1 c2 a1 b2 c1 a1 b2 c2 a2 ...

2015-01-16

  • pony2001mx 发表了新话题 2015-01-16 21:52
    如何实现多任务并行运行
    大家好: 我想在脚本里多任务并行运行, 举个例子如下。下面脚本运行得太慢了，因为一次运行一个文件（command那行），我有几千个后缀为.fa的文件， 如何一次运行 ...

2015-01-07

  • pony2001mx 发表了新话题 2015-01-07 13:23
    hash排序问题
    大家好： 我的脚本的理想输出结果如下，因为我想按ma, liu, lin排序的： a: ma=mu c: lin=zhang b: liu=ma 但结果是： c : lin : zhang a : ma : mu b ...

2014-12-26

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-12-26 10:19
    检测BLAST软件是否安装
    大家好： 我在perl程序里检测BLAST软件是否安装上，用到下面命令，为什么不输出ERROR: blast not installed信息？ （注：BLAST没有安装） 谢谢指点迷津！ s ...

2014-12-25

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-12-25 09:37
    如何将屏幕上的信息输入log文件
    大家好： 我用下述命令把一些信息输入log文件。但运行过程中的错误信息会输出在屏幕上，而不输出在log文件里。如何解决？谢谢！ use IO::File; my $logfile ...

2014-12-24

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-12-24 17:28
    如何return跳出子程序？
    大家好： 我写了个程序用return -1跳出子程序（subroutine），但出错了，我举例如下，我希望的结果是。在10的时候跳出子程序。谢谢指点迷津！

2014-12-18

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-12-18 15:27
    our相对于my的好处是什么？
    大家好： 我读到一个perl脚本，最开始声明our $score_cutoff = 2; 我觉得用my $score_cutoff = 2; 也可以啊？我对our和my知道一点，但还不是非常精通。 请教高 ...
  • pony2001mx 发表了新话题 2014-12-18 14:15
    wget不掉线的方法是什么
    大家好： 我尝试以下三个wget命令下载，但都有时断线，wget不掉线的方法是什么？ wget -c -i download.txt --http-user=xxx --http-passwd=xxxxxx -T 60 wge ...

2014-12-17

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-12-17 10:28
    wget命令参数-t，-T，-w
    大家好： 我用wget下载文件，因为文件大，必须断点续传，有三个参数不太明白，包括 -t -T -w 以下的命令哪个更好，有何区别？非常谢谢！！

2014-11-21

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-11-21 17:41
    找出所有组合
    大家好，我有一个难题，请教高人指点。对于每个ID(第一列)，找出所有首尾相连（从1连到100）的组合。非常谢谢您的帮助！！ a 1-30 A a 9-30 B ...

2014-11-20

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-11-20 18:46
    array的array的sort问题
    我有一个问题，求解答。我有一个@array，想根据左列值从小到大sort一下，成为@array—copy。 232 309 132 300 933 988 290 304理想的输出结果是 132 3 ...

2014-11-19

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-11-19 22:13
    筛选问题
    大家好：请教一个问题，求perl程序。我需要筛选包含区间1-100的ID，例如下表s1和s4包含了区间1-100，是我想要得到的。非常谢谢！！ ID 区间 s1 1-30 s1 ...

2014-11-09

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-11-09 07:08
    中间临时文件
    大家好： 我写了个脚本，产生一些中间文件（pr.tmp, gene.tmp之类的）。现在有一个问题，如果我在两个终端同时运行该脚本，采用不同的input数据，这样会有冲突 ...

2014-10-21

2014-10-11

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-10-11 16:04
    一个简单的替换问题
    我有一个字符串，比如$a="a-afoa-fd--f----a", 我需要在每两个字母间插入一个0，我的命令是$a=~s/(\w)(\w)/$1\0$2/g，有错误，请大家指点，非常谢谢！！

2014-10-09

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-10-09 16:53
    归类问题
    大家好： 我有一个挠头的问题，我的文件如下，想把基因归类。请指点迷津，非常谢谢！！ AT2G07748 AT2G07750 AT2G07749 ATMG01410 AT2G07750 AT2G07750 AT ...

2014-09-26

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-09-26 14:33
    一旦不用ref了，马上设为空值？
    大家好， 我的脚本里面用到很多hash ref和数组ref，请问是否有必要一旦不用这些ref了就马上设为空值，这样缓解内存，程序运行得更快？我的理解是否正确？谢谢指 ...

2014-09-25

2014-09-22

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-09-22 15:24
    返回hash还是hash的reference？
    大家好： 我的perl脚本里有一个名为store_into_hash的子程序，调用它数次，主要是把DNA序列名称和序列信息存入hash。我的问题是：return值是%hash好还是%hash的 ...

2014-09-17

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-09-17 21:27
    system命令
    大家好： 我在perl脚本里用了一个system命令如下。但出现错误提示：sh: -c: line 0: syntax error near unexpected token `(' 我在终端运行命令没错呀，请教高 ...

2014-09-12

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-09-12 16:18
    为什么多输出一行？
    大家好：请教一个简单，但对我很不解的问题。我的脚本为什么输出三行，为什么不是两行？谢谢！！ 文件fileperl脚本

2014-09-11

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-09-11 15:12
    脚本运行非常慢，求指点
    大家好： 我有两个大文件（每行是名称和肽段序列），第一个约9百万行；第二个几十万行。我需要输出的肽段是：存在于第一个文件，但在第二个文件找不到（即不匹配 ...

2014-09-06

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-09-06 21:52
    合并三个文件
    大家好： 我有三个文件需要合并，我用以下命令，有没有更简洁的命令? 请高手指点！！非常谢谢！！文件outmir: gr2 mi2 gr2 mi33 gr1 mi3 文件outgene: ...

2014-09-05

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-09-05 22:45
    合并三个文件
    大家好 我想合并三个文件, 目前的方法执行两次LINUX SHELL的sort, join命令. 有没有perl的好方法? 可能复杂些, 我实在不知道思路, 希望有空的时候帮我想想, ...
  • pony2001mx 发表了新话题 2014-09-05 14:42
    perl脚本运行为何这么慢？
    大家好 我有两个文件，需要合并，我写了个perl脚本，觉得很容易的事，可是运行的非常非常慢（当然，两个文件都有几十兆）。之后我用sort和join命令运行的非常之 ...

2014-08-21

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-08-21 16:47
    合并两个文件
    大家好： 我有两个文件，需要根据第二列合并两个文件，我用join -1 2 -2 2
  • pony2001mx 发表了新话题 2014-08-21 10:51
    hash的hash的hash的hash
    大家好： 我昨天提出一个相似的问题，高手们慷慨相助，但是我还是有一个关于hash的hash的hash的hash的问题，再次请教。 我的目的是把data1.txt（字段1--字段2- ...

2014-08-20

2014-08-04

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-08-04 15:06
    用perl作图
    大家好： 我有如下数据（仅是个例子），如何用perl做成如下的图？求大家的慷慨指教，非常谢谢！ 数据： 长度 蛋白AT 1-70 肽段01 1-20 肽段01 10-30 肽 ...

2014-07-14

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-07-14 15:03
    一个简单sub问题
    大家好： 我发现有的程序中有如下结构： sub DNAtranslation（） { ...内容... } 我把DNAtranslation后面的括号去掉，好像并不影响程序运行，请教大家是 ...

2014-07-05

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-07-05 18:35
    foreach循环
    大家好： 我想输出所有长20个字母的字符串，只能为a，b，c和d，其中a、b、c的总数小于等于7。以下foreach循环脚本哪里有误？谢谢！

2014-06-25

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-06-25 14:34
    Perl模块的使用方法
    大家好： 我装上一个模块 Algorithm::NeedlemanWunsch， 可以用来比较两个核酸序列。perldoc这个模块显示如下信息。我的问题是：如何使用这个模块？比如比较两个 ...

2014-06-14

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-06-14 09:35
    STDIN问题
    大家好： 我的脚本中有STDIN，但它影响perl命令行用>输出。具体如下，我的脚本名是calculation.pl但是，当我运行 perl calculation.pl > output 时， 处于停滞状 ...

2014-06-10

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-06-10 20:41
    小问题
    大家好： 我也一个小问题，以下命令为什么在不灵？非常谢谢！ perl -ne '$a="abc"; $b="a"; if ($a =~ /$b/){print "ok"}'

2014-06-04

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-06-04 18:05
    小脚本意外结果
    大家好：我的如下脚本输出结果不是我想象的，为什么？谢谢指点！！ while(my $line = ){ chomp $line; $h{$line} = 1; print "$line=>$h{$line}"." ...
  • pony2001mx 发表了新话题 2014-06-04 09:45
    while嵌套问题（续）
    我昨天发表了一个while嵌套问题（http://bbs.chinaunix.net/thread-4140711-1-1.html），stanley_tam 慷慨回复，但我还有一点不理解的，以下脚本中为什么用print ...

2014-06-03

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-06-03 21:31
    while 嵌套问题
    我以下面的简单脚本(test.pl ) 举例：文件1（file1.txt）内容： a b c 文件2（file2.txt）内容： 1 2 运行命令为 perl test.pl file1.txt file2.txt ...

2014-05-06

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-05-06 15:13
    hash of hash
    大家好： 我有以下数据： at1g001 t1 m1 at1g002 t3 m2 at1g002 t3 m2 at1g002 t4 m5 ..... （注：三列为基因名、处理号和样品号。） 我需要 ...

2014-02-12

  • pony2001mx 发表了新话题 2014-02-12 15:23
    local具体用途
    在DNA序列文件中每个序列的ID以>开头，见如下文件： >seq1 ATGCTAGCTAGCTACGATCGATGCATCGATCGATCGATCG >seq2 GCGCCGCGGCTATTCGCGTTGACTGCTGACTGCATGACTG ...