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Chinaunix

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动态

2016-05-07

  • biobaby 发表了新话题 2016-05-07 08:29
    awk
    大家好，急求代码： 有文件a.txt:如下，每4行是一个数据单元，因此第一行11a，第5行23b2，第9行54c，第13行67是单元名，每行跟着的3行是单元信息。现在想从中抽 ...

2016-04-05

  • biobaby 发表了新话题 2016-04-05 20:18
    shell
    大家好，我有这样一个文件file.文件信息如下： chr1 23 25 + ACT chr2 11 15 + ACTGA chr5 4 10 - GCTAGCT ...

2016-03-25

  • biobaby 发表了新话题 2016-03-25 14:46
    shell
    大家好：我有这样一个文件file,格式如下： N1 5 6 8 4 1 2 1 0 1 2 N2 5 6 5 6 9 1 2 4 4 2 N3 1 3 5 6 7 8 2 1 0 0 现在想提取符合以下条件的行： 第二列大 ...

2016-03-01

  • biobaby 发表了新话题 2016-03-01 13:50
    shell
    大家好 我有这样一个文件：file.txt内容格式类似如下： >a 1223 asdddffff4 >b fjkjfgyhjo56789 >c dfghj5tyh3ed 9uyhve63bdni jedneu >d 5678uhbh ...

2016-02-20

  • biobaby 发表了新话题 2016-02-20 14:58
    shell perl
    求助：大家好 我有两个文件，内容如下： file1.txt: OS01T0100100-01 OS01T0100200-01 OS01T0100300-00 OS01T0100400-01 OS01T0100466-00 file2.txt: > ...

2016-02-19

  • biobaby 发表了新话题 2016-02-19 18:48
    shell
    大家好， 程序问题下望大家帮忙：现有一个文件file.txt,其文件格式如下：第五列 和第六列分别用；隔开的信息， 而且两列每一个；隔开得信息是对应的。 也就是第五 ...

2016-01-27

  • biobaby 发表了新话题 2016-01-27 12:56
    shell
    大家好，我这里有一个文件想要合并第一列相同的那些行。 比如：文件file,内容如下： wo 1 2 3 wo d j u ni 8 h 3 ni e 3 9 ni 3 k 5 ta 1 6 0 he h 6 9 ...

2015-08-21

  • biobaby 发表了新话题 2015-08-21 12:11
    AWK
    求助： 求助各位大神： 现在有这样一个文件， 每四行是一个单元： 如下： >1 ABDGC +++++ 12345 >2 AHNHB ++72= 12ji2 >3 CCHLJ *&=-+ 658hk >4 ...

2015-08-06

  • biobaby 发表了新话题 2015-08-06 14:40
    shell
    各位大家好，我有一个文件如下: chr1 1 - a chr1 2 - b chr2 1 - c chr2 2 - d chr2 3 - e chr2 4 ...

2015-06-09

  • biobaby 发表了新话题 2015-06-09 15:13
    shell
    大家好，我有这样一个文件 如下： 1 49M1D52M 3 74M3I2D27M 6 13S14M2D74M 4 32M2D69M 7 8M1I17M2D75M 4 21M1D80M 5 17M1D7 ...
  • biobaby 发表了新话题 2015-06-09 10:58
    AWK
    请教各位大神： 我这里有一个文件都是字符 ABDCTGVMIN 请问图和将每行切换成一个字符一列的形式？结果如下 A B D C T G V M I N 分隔符用tab 谢谢大 ...

2015-05-26

  • biobaby 发表了新话题 2015-05-26 20:14
    shell
    chr1 11947 12223 TC01000001.hg.1 + chr1 12613 12646 TC01000001.hg.1 + chr1 12646 12697 TC01000001.hg.1 + chr1 13228 13392 ...

2015-05-20

  • biobaby 发表了新话题 2015-05-20 14:44
    shell
    大家好 ，我有这样一个文件：若干行，形式如下 a 1.33516 548.89 b 1.37001 418.06 c 1.39725 649.82 d 1.45548 221.97 e ...

2015-05-06

  • biobaby 发表了新话题 2015-05-06 13:47
    shell
    大家好，有这样一个文件： chr1 na chr4 5 chr3 na chr6 5 chr4 na chr7 5 现在我想替换掉第三列的chr这几个字母，但是第一列 ...

2015-04-07

  • biobaby 发表了新话题 2015-04-07 19:01
    shell
    大家好 我有这样一个文件：每一行的列数不统一，但都是3的倍数，每三列是一个单元 类似下边的情况 a1 b1 c1 a2 b2 c2 a4 b4 c4 a3 b3 ...

2015-03-23

  • biobaby 发表了新话题 2015-03-23 16:14
    shell
    大家好，我有这样一个文件 >1 ASBGSJKLDNBJHFKJLSJLLSBHGBHJDGHSKUJIOARKRL >2 OPUIYBMLKLJIHFRDRSDGCCGUYHIJMLKMKOK >3 QWERTYUIOPLLKJHGFDSZVBNMKJHGFDC ...

2015-03-19

  • biobaby 发表了新话题 2015-03-19 10:01
    shell
    大家好 ，我想学一下 批量写脚本的方法，比如有一个路径下有很多文件夹，我想在每个文件夹下建一个文件夹fold,我是这样写的，大家帮我看看怎么不行啊？ for ...

2015-03-11

  • biobaby 发表了新话题 2015-03-11 13:40
    shell
    大家好，我有这样一个两列的文件，内容是在某个距离上的个数，文件已经按距离排好序，但不只是这些行：如下所示： distance number -10 39 -9 40 -8 53 ...

2015-03-10

  • biobaby 发表了新话题 2015-03-10 17:03
    shell
    大家好 我有一个类似如下这样的a文件： sun 31 43 21 ma 112 32 44 he 21 56 100 sun 33 44 33 chen ...

2015-03-06

  • biobaby 发表了新话题 2015-03-06 13:52
    shell
    大家好 我有一个这样的文件a 如下： chr10 100194712 100194741 * * - chr10 100195407 100195535 666 chr10 ...

2015-01-17

  • biobaby 发表了新话题 2015-01-17 10:37
    shell
    大家好，我有这样一个文件，例如文件a.txt 如下所示： 1 a.1 ma 3 d.1 3 5 c.2 4 2 f.4 4 想要把第二列的点和其后边的数字替换掉，直接用 ...

2014-12-25

  • biobaby 发表了新话题 2014-12-25 14:59
    shell
    大家好：我有这样一个文件a.fasta： >chr10:117704304-117704335(-) CCAGAGCAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCC >chr10:117704309-117704340(-) GAGTTCCAGAGCAGCCAGGG ...

2014-11-15

  • biobaby 发表了新话题 2014-11-15 16:08
    文件目录
    请问如何对一个目录下的文件做相同的操作： 比如说 我有一个目录C:/a/b 该目录下有很多文件夹aa,bb，cc等，我想将每一个小文件夹下边的所有文件 合起来 ？请问 ...

2014-10-20

  • biobaby 发表了新话题 2014-10-20 21:47
    unix
    大家好，有这样一个问题： >a1 1 >a1 11 >a1 111 >a2 2 >a2 22 >b1 3 >b1 33 想将各个title 下边的合在一起 输出如下： >a1 1 11 111 >a2 ...
  • biobaby 发表了新话题 2014-10-20 19:36
    awk
    请问如何在某些行末尾加上相同的信息： 如下： a 1 b 2 c 4 生成这样的结果： a_j 1 b_j 2 c_j 4 谢谢！

2014-10-14

  • biobaby 发表了新话题 2014-10-14 22:09
    shell
    请问awk怎样实现同时判断一个文件的多列同时满足同一个条件：比如 a 1 0 3 4 0 1 4 b 6 0 3 42 0 1 0 c 1 3 3 4 4 1 ...

2014-09-25

  • biobaby 发表了新话题 2014-09-25 19:28
    awk
    大家好，我现在有这样一个以逗号“，”为分隔符的文件文件： a,2,a11,a12,a21,a22 b,4,b11,b12,b21,b22,b31,b32,b41,b42 c,1,c11,c12 d,3,d11,d12,d21,d22,d ...

2014-08-22

  • biobaby 发表了新话题 2014-08-22 19:36
    awk
    求助，awk处理文件： 文件a: sun 21 m liu 19 n li 23 o ma 22 h 文件b： he 20 g sun 2 ...

2014-08-20

  • biobaby 发表了新话题 2014-08-20 19:21
    shell
    请问怎样用shell命令给一个文件添加表头：像这样： a 3 b 5 结果是这样： name score a 3 b 5

2014-08-19

2014-08-14

  • biobaby 发表了新话题 2014-08-14 19:05
    awk
    有两个文件。 第一个文件a有14列，第二个文b件有2列。 现在想要得到第一个文件a的第13列 和 第二个b文件的 第一列相同的行。请问怎么实现？
  • biobaby 发表了新话题 2014-08-14 12:43
    怎样用awk
    有这样一个问题： a 2 b 4 c 13 d 11 e 3 f 10 想要输出结果是将第二列大于10 的数 都标准化为10： 即： a 2 b 4 c 1 ...
  • biobaby 发表了新话题 2014-08-14 10:26
    关于 R语言的table 运算
    大家好，我刚开始学习R语言，有些地方不太了解： 有一个表 table（a）是这个样子的：第一行可以看成是位点 第二行看成是人数 -3 -2 -1 0 1 2 ...

2014-08-12

  • biobaby 发表了新话题 2014-08-12 19:54
    shell 文件排序
    我有这样一个文件： 1 a 3 s 2 f 5 g 7 j 4 t 9 r 6 w 8 l 现在我想按照第一列的值的大小将文件分成三组，每一行后边标出改行属于第几组。 这里也就是 ...
  • biobaby 发表了新话题 2014-08-12 19:17
    shell 文件处理
    我有一个这样的文件a.txt： a;b;c;d; 3 e;f 2 g 4 h 5 然后想要得到这样的结果： a 3 b 3 c 3 ...

2014-07-23

  • biobaby 发表了新话题 2014-07-23 14:29
    SNP calling
    为什么用HaplotypeCaller 算法call SNP 时， call 到的结构第三列没有rs号信息。 而且 之后的矫正过程中并不能把SNP和 indel分开。 下面是我的代码： java -X ...

2014-07-22

  • biobaby 发表了新话题 2014-07-22 13:40
    shell 文件处理
    怎样对一个路径下边的所有相同格式的文件进行相同的操作。 例如： 对当前目录下 若干个bed问价 提取其中的第一列和第二列， 然后每个文件生成出一个新文件。

2014-07-19

  • biobaby 发表了新话题 2014-07-19 19:34
    文件信息提取
    大家好，初学shell 命令 好多不会的。 我这里有两个文件file1: file2：想请问怎么样从file1里边提取出来包含file2信息的那些行，要求file1 的输出结果是整行的。 ...
  • biobaby 发表了新话题 2014-07-19 17:29
    文本处理
    文件a: 文件b: 想要得到a 中的rs号 在b中对应的疾病列表， 并统计个数。
  • biobaby 发表了新话题 2014-07-19 16:10
    关于文件交集的查找
    我有两个文件，一个是所有基因的集合 称作a文件，只有基因号。 另一个文件是我自己的结果文件称作b文件，里边有几列 第三列是基因号，其他列是其他信息。 请问我 ...