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关于bioperl的安装,各位牛人帮忙看看这个问题吧~ [复制链接]

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发表于 2008-02-15 20:47 |只看该作者 |倒序浏览
#/usr/bin/perl -w
use Bio:erl;
# this script will only work with an internet connection
# on the computer it is run on
$seq_object = get_sequence('swissprot',"ROA1_HUMAN";
write_sequence(">roa1.fasta",'fasta',$seq_object);

新安装了bioperl,因此想测试一下是否正常
结果出现这段结果,那位牛人能否解释一下,为什么?谢谢,xp系统下

------------- EXCEPTION  -------------
MSG: swissprot stream with no ID. Not swissprot in my book
STACK Bio::SeqIO::swiss::next_seq C:/Perl/site/lib/Bio\SeqIO\swiss.pm:180
STACK Bio:B::WebDBSeqI::get_Seq_by_id C:/Perl/site/lib/Bio/DB/WebDBSeqI.pm:154

STACK Bio:erl::get_sequence C:/Perl/site/lib/Bio/Perl.pm:513
STACK toplevel bioperl.pl:5

--------------------------------------

[ 本帖最后由 ericson114 于 2008-2-15 21:42 编辑 ]

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发表于 2008-02-18 13:07 |只看该作者
问题已经解决。。
谢谢~
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