MPICH的安装和配置

shijiang1130

MPICH的安装和配置
　　
　　
　　MPICH是MPI的一种具体实现。下面以1.2.4版本为例，介绍如何在Linux上安装和配置MPICH，此处采用的操作系统为Red
Hat 7.3。
　　
　　1.下载MPICH软件包
　　
　　根据需要及机器配置的不同，可从://www.mcs.anl.gov/mpi/mpich/download.html下载相应的MPICH软件包。此处采用的软件包是mpich-1.2.4.tar.gz。
　　
　　$ tar xzvf mpich-1.2.4.tar.gz
　　$ cd mpich-1.2.4
　　
　　$
./configure --prefix=/usr/local
　　$ make
　　
　　4.测试编译的正确性
　　
　　$ cd examples/basic/
　　$ make cpi
　　$ ../../bin/mpirun -np 4
cpi
　　
　　
　　
　　若该程序能正确运行，则表明整个MPI软件包的编译是正确的。注意，若在运行测试程序时出现“Permission
denied.”的错误信息，可以试着以其它用户或重新登录后再运行该测试程序。
　　
　　5.安装MPICH软件包
　　
　　如果测试程序能够正确运行，则表明整个编译过程是正确的，此时就可以通过以下命令的执行来安装MPICH软件 $ cd ../../
　　$ su -c “make install”
　　
　　6.权限设置
　　
　　为了能够在多个不同的机器上运行MPI程序，首先需要其它机器对启动MPI程序的机器放权，即允许启动MPI程序的机器访问其它机器。权限的设置主要有两种方法，一种是在其它所有机器的/etc/hosts.equiv文件中加入启动MPI程序的机器名。例如要在node1这台机器上启动MPI进程，而计算过程中要用到node2和node3两台计算机，则需要在node2和node3机器的/etc/hosts.equiv文件中加入如下一行：
　　
　　node1
　　
　　
　　
　　这样就使得node2和node3都允许node1通过rlogin、rsh等命令进行访问。为了使一台机器能够同时运行多个
node1
　　
　　如果/etc/hosts.equiv文件不存在，则需要先创建该文件。
　　
　　设置权限的另外一种方法是通过.rhosts文件来实现。具体的做法是对MPI程序运行过程中要用到的所有计算机，在运行该程序账户的Home目录下创建一个.rhosts文件，并在该文件中标明允许哪些机器的哪些账户进行访问。
　　
　　例如，在node1、node2和node3机器上都有gary这一账号，若要允许node1机器上的gary账号能够分别对nod node1
gary
　　
　　为了简便起见，最好在每个机器上都建立相同的账户名，使得MPI程序能够在相同的账户下运行。以上的配置都是基于R系列命令的（包括rlogin、rsh、rexec等），这种配置对于一般应用来说已经足够了。但如果并行计算环境要求有相当高的安全性，则应该考虑用SSH来代替R系列命令，具体的做法请参考MPICH的相关文档。
　　
　　7.主机设置
　　
　　要使MPI程序启动后能够在多个主机上并行执行，还必须对可用的主机进行设置，相应的配置文件为/usr/local/share/machines.LINUX。编辑该文件，在每一行写上可用的机器名。例如，只要在该文件中添加以下几行：
　　
　　node1
　　node2
　　node3
　　
　　就可以有3台计算机供MPI使用。
　　
　　至此，MPICH在一台机器上的安装和配置过程就基本结束。将相同的步骤应用于并行计算环境中其它的计算机后，就可以构造出一个基于MPICH的并行计算平台。
　　
　　PVM的安装和配置
　　
　　PVM免费、开放的特性使得它成为一个被广泛接受的并行程序开发环境。它可以安装到Linux、Unix和Windows等多种操作系统上。以下以3.4.4版本为例，介绍如何在Linux平台上安装和配置PVM。
　　
　　1.下载PVM软件包
　　
　　根据需要及机器配置的不同，可以从http://www.netlib.org/pvm3/index.html下载相应的PVM软件包。此处采用的软件包是pvm3.4.4.tgz。
　　
　　$ cp pvm3.4.4.tgz /usr/local/src/
　　$ cd /usr/local/src/
　　$
tar xzvf pvm3.4.4.tgz
　　
　　3.设置环境变量
　　
　　PVM在启动和运行的过程中需要用到环境变量PVM_ROOT和PVM_ARCH。每个要用到PVM的用户都需要设置这两个环境变量。环境变量PVM_ROOT的值为PVM软件包展开后根目录所在的位置，此处应该设为“/usr/local/src/pvm3”。环境变量PVM_ARCH的值标明了主机所对应的体系结构，对于运行Linux操作系统的主机来说，该值即为“LINUX”。
　　
　　若使用的是bash，则为主机上所有用户添加这两个环境变量的方法是在/etc/bashrc文件中添加如下两行脚本：
　　
　　export PVM_ROOT=/usr/local/src/pvm3
　　export PVM_ARCH=LINUX
　　
　　若使用的是csh，则应该在/etc/csh.cshrc文件中添加如下两行脚本：
　　
　　setenv PVM_ROOT
/usr/local/src/pvm3
　　setenv PVM_ARCH LINUX
　　
　　$ source /etc/bashrc
　　
　　4.编译PVM软件包
　　
　　当设置的环境变量生效后，执行下面的命令来编译整个软件包：
　　
　　$ cd
/usr/local/src/pvm3
　　$ make
　　
　　5.建立符号连接
　　
　　如果编译过程一切正常，则在/usr/local/src/pvm3/lib目录下生成可执行脚本pvm。为了今后使用方便，可以为其建立相应的符号连接：
　　
　　$ su -c “ln -s /usr/local/src/pvm3/lib/pvm \
　　>
/usr/local/bin/pvm”
　　
　　6.权限设置
　　
　　PVM的权限设置与MPICH相同，既可以直接修改/etc/hosts.equiv文件，也可以修改每个账号Home目录下的.rhosts文件。例如，若要在node1机器上启动PVM进程，而计算过程中还需要用到node2和node3两台计算机，则
node1
　　
　　这样使得node1能够通过rlogin、rsh等命令访问node2和node3。
　　
　　7.主机设置
　　
　　大部分Linux发行版，都在/etc/hosts文件中将主机名作为本机回送地址的别名添加到127.0.0.1一行中，以
127.0.0.1 node1 localhost
　　
　　127.0.0.1 localhost
　　
　　至此，PVM在一台机器上的安装和配置过程就基本结束了。将相同的步骤应用于并行计算环境中其它的计算机后，就能够构造出一个基于PVM的并行计算平台了。
　　
               
               
               

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