Ubuntu 6.06安装MPICH（采用基于密钥的ssh认证）

JJCH

                               
1.linux安装
采用ubuntu 6.06.1 LTS 版本。
2.创建NFS服务
  sudo apt-get install nfs-common nfs-kernel-server
在服务器节点/home目录下建立mpi目录，并将其配置成NFS服务器，在/etc/exports
文件中加入一行：
  /home/mpi  node1(rw)  node2(rw)
在客户端节点的/etc/fstab文件中增加一行：
  node1:/home/mpi /home/mpi nfs  rw,bg,soft  0 0
将/home/mpi这个目录从服务器节点输出，并装载在各客户端的/home/mpi目录下，从而便于在各节点间分
发任务.

3.修改/etc/hosts文件，将所有节点名称极其ip地址填入。例如：
  127.0.0.1　localhost.localdomain localhost
  219.242.255.161　node1
  219.242.255.162　node2
  ......................
每个节点都进行类似的配置。这样做的目的是使节点之间能够通过node1 ... noden的名
称相互访问。你可以通过ping noden 或 ssh noden进行测试。

4.安装配置ssh
  sudo apt-get install openssh-client openssh-server
以设定的用于启动mpi计算的用户登录，运行
  ssh-keygen -t rsa    #对于所有提示直接回车即可
这将生成一个密钥对，分别存放在~/.ssh/id_rsa和~/.ssh/id_rsa.pub文件内。
然后进行访问授权，运行：
  cp ~/.ssh/id_rsa.pub ~/.ssh/authorized_keys
  chmod go-rwx ~/.ssh/authorized_keys
  ssh-agent $SHELL
  ssh-add
在每个节点重复一遍。收集所有节点下的authorized_keys文件，合并为一个authorized_keys，然后再分发到每个节点的$HOME/.ssh目录下去。
试着在某一节点上登录所有节点（包含自身），ssh noden，则在$HOME/.ssh/下生成一个名为known_hosts的文件，里面放着访问该主机的身份指纹，也在各个节点上将known_hosts文件作同样的拷贝。
以上的目的是使各节点相互之间访问无需输入密码。
5.开启各项必需的服务
  ssh
  nfsd
  networking
6.在各节点编译、安装mpich2.(详情参考安装文档)
  ./configure --prefix=/usr/local
  make
  make install
7.配置
  在$HOME目录下执行
   touch ~/.mpd.conf
  在里面输入
   secretword=  #为任意你所想填写的字符串，如"mysecret"
  再执行
   chmod 600 ~/.mpd.conf
  编写一个mpd.hosts文件，内容如下：
   node1  #集群中各节点名,一行一个
   node2
   ......  
  
8.测试安装是否正确
   mpdboot -n number -f mpd.hosts  #number为要启动的节点数，mpd.hosts为包含机器名的文件
   mpdtrace                        #查看已启动的节点
   mpdallexit                      #所有节点退出
   
  拷贝/usr/local/share/examples_graphics下的用例到其他目录，编译cpi.c:
   mpicc -o cpi cpi.c
  再执行：
   mpdboot -n 2 -f mpd.hosts
   mpiexec -n 2 cpi
  将会获得如下信息
   Process 0 on node1
   Process 1 on node2
   ..................
  单机上模拟多节点可以用如下方式：
   mpd&   #启动mpi任务管理服务,只启动本节点的mpd
   mpiexec -n 2 cpi
  如果都能正常运行即证明集群环境安装成功。
  

               
               
               
               

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