哪位大哥知道东北做linux HPC的商家？

longmethod

有几家给出了相当的配置，正在考虑中，多谢。

另外，是要2台四路的，还是四台双路的？有人提出四路的两台好些。

nntp

原帖由 longmethod 于 2006-12-19 17:22 发表
有几家给出了相当的配置，正在考虑中，多谢。

另外，是要2台四路的，还是四台双路的？有人提出四路的两台好些。

你真的熟悉你要处理的生物学计算的软件和计算类型么? 如果你就是用户，应该很清楚自己用的软件到底是怎样的状况把?

到底是2台4way还是4台2way,完全取决于你的软件到底是怎样的计算特点。如果不是分布依赖的，买的再多的机器跑了也是白跑.

我爱钓鱼

原帖由 nntp 于 2006-12-19 20:55 发表


你真的熟悉你要处理的生物学计算的软件和计算类型么? 如果你就是用户，应该很清楚自己用的软件到底是怎样的状况把?

到底是2台4way还是4台2way,完全取决于你的软件到底是怎样的计算特点。如果不是分布依赖 ...

我见过生物学计算的是用高斯之类的软件算的，还是可以用HPC的。不过，不知道LZ到底用什么软件。。。。

straw

生物学计算用的最多的计算类型就是隐马儿科夫型的算法。一般涉及到需要计算的有基因比对blast,序列拼接,还有一些分子模型中的3维结构，和特定仪器相关的数据处理。当然也有自己研究算法解决问题的，不过这类研究机构不多，据我所知目前就上海一家研究所专门在搞。生物学计算的大部分问题都可以分解成多个任务同时计算，最后把结果整合一下就好了。这样的处理是很容易的，只要你的计算不吃内存，买什么机器都是无所谓的。

nntp

原帖由 straw 于 2006-12-20 09:45 发表
生物学计算用的最多的计算类型就是隐马儿科夫型的算法。一般涉及到需要计算的有基因比对blast,序列拼接,还有一些分子模型中的3维结构，和特定仪器相关的数据处理。当然也有自己研究算法解决问题的，不过这类研究机 ...

我保留意见.以我所接触的生物计算方面的hpc项目来看，并非如此.

straw

可能我在一个地方呆的太久了，呵呵，不过最近发现用R的人特别的多