免费注册 查看新帖 |

Chinaunix

  平台 论坛 博客 文库
最近访问板块 发新帖
查看: 2418 | 回复: 3
打印 上一主题 下一主题

求生物信息perl程序! [复制链接]

论坛徽章:
0
跳转到指定楼层
1 [收藏(0)] [报告]
发表于 2011-03-27 11:35 |只看该作者 |倒序浏览
  1. BGIBMGA000058-TA           nscaf1071         1083932        1085028
  2. BGIBMGA000059-TA           nscaf1071         1144201        1144993
  3. BGIBMGA000060-TA           nscaf1071         1194454        1203962
  4. BGIBMGA000061-TA           nscaf1071         1233907        1234573
  5. BGIBMGA000062-TA           nscaf1071         1239819        1245122
  6. BGIBMGA000063-TA           nscaf1071         1293757        1306270
  7. BGIBMGA000064-TA           nscaf1071         1313232        1316001
  8. BGIBMGA000065-TA           nscaf1087         2451        9117
  9. BGIBMGA000066-TA           nscaf109         1549        4332
  10. BGIBMGA000067-TA           nscaf1108         3401547        3415278
  11. BGIBMGA000068-TA           nscaf1108         2724200        2728350
  12. BGIBMGA000069-TA           nscaf1108         2546311        2574462
  13. BGIBMGA000070-TA           nscaf1108         2533757        2534560
  14. BGIBMGA000071-TA           nscaf1108         2527802        2528488
  15. BGIBMGA000072-TA           nscaf1108         2442934        2452908
  16. BGIBMGA000073-TA           nscaf1108         2382927        2390096
  17. BGIBMGA000074-TA           nscaf1108         2370811        2374956
  18. BGIBMGA000075-TA           nscaf1108         2350982        2353168
  19. BGIBMGA000076-TA           nscaf1108         2305769        2312842
  20. BGIBMGA000077-TA           nscaf1108         2238841        2239515
  21. BGIBMGA000078-TA           nscaf1108         2207199        2212812
  22. BGIBMGA000079-TA           nscaf1108         2140463        2140972
复制代码
  1. +        BGIBMGA000062-TA         FWDP30_FL5_P09.seq        nscaf1071        1318628        1239395        1240559
  2. +        BGIBMGA000062-TA         MFBP02_F_H18.seq        nscaf1071        1318628        1239668        1243526
  3. +        BGIBMGA000064-TA         fdpeP10_F_J11.seq        nscaf1071        1318628        1313192        1316067
  4. +        BGIBMGA000064-TA         MFBP04_F_N06.seq        nscaf1071        1318628        1313197        1316106
  5. +        BGIBMGA000128-TA         FWDP26_FL5_O06.seq        nscaf1108        3459965        1275912        1278501
  6. +        BGIBMGA000129-TA         FWDP02_FL5_F17.seq        nscaf1108        3459965        1283141        1319375
  7. +        BGIBMGA000129-TA         FWDP02_FL5_O19.seq        nscaf1108        3459965        1282859        1319327
  8. +        BGIBMGA000129-TA         FWDP10_FL5_A23.seq        nscaf1108        3459965        1283141        1319395
  9. +        BGIBMGA000129-TA         FWDP31_FL5_I15.seq        nscaf1108        3459965        1283115        1319315
  10. +        BGIBMGA000129-TA         MFBP15_F_I08.seq        nscaf1108        3459965        1283141        1319403
  11. +        BGIBMGA000140-TA         FWDP04_FL5_M21.seq        nscaf1108        3459965        1773552        1776967
  12. +        BGIBMGA000140-TA         FWDP25_FL5_J23.seq        nscaf1108        3459965        1785487        1791348
  13. +        BGIBMGA000154-TA         FWDP03_FL5_B14.seq        nscaf1108        3459965        2355076        2357513
  14. +        BGIBMGA000154-TA         fdpeP09_F_E13.seq        nscaf1108        3459965        2355077        2357478
  15. +        BGIBMGA000155-TA         fdpeP13_F_N09.seq        nscaf1108        3459965        2429759        2436013
  16. +        BGIBMGA000201-TA         MFBP02_F_D11.seq        nscaf1299        357319        349886        350726
  17. +        BGIBMGA000202-TA         MFBP13_F_J17.seq        nscaf1375        11050        7946        8756
  18. +        BGIBMGA000360-TA         fdpeP16_F_J16.seq        nscaf1681        5888100        45406        46743
  19. +        BGIBMGA000360-TA         fdpeP07_F_A13.seq        nscaf1681        5888100        45375        46693
  20. +        BGIBMGA000362-TA         fdpeP08_F_F04.seq        nscaf1681        5888100        90916        94336
复制代码
有个问题还没有解决,在这里还需要程序高手的帮助!谢谢了

是这样的:


第一个文件和第二个文件 都有

基因名   ncafxxxxxx     的组合,在刚才的计算操作之前,再加一步操作:

以第一个文件的  基因名   ncafxxxx 为基准,如果第二个文件里的  基因名  ncafxxxx  和第一个文件里的不一致 就把这行它删除


例如:
第一个文件中

BGIBMGA009573-TA    nscaf2962   的组合

第二个文件中如果是


BGIBMGA009573-TA    nscaf2891  的组合的话,就把第二文件这行删除




在上边的例子的数据比较少,可能体现不出来,我上传下文件!

全部数据.zip

235.43 KB, 下载次数: 55

论坛徽章:
0
2 [报告]
发表于 2011-03-27 13:08 |只看该作者
顶一个!

论坛徽章:
0
3 [报告]
发表于 2011-03-27 14:52 |只看该作者
跪求,perl 程序!紧急阿

论坛徽章:
0
4 [报告]
发表于 2011-03-27 16:39 |只看该作者
回复 1# aids260


    好的,谢谢大家,这个问题解决了啊,谢谢
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则 发表回复

  

北京盛拓优讯信息技术有限公司. 版权所有 京ICP备16024965号-6 北京市公安局海淀分局网监中心备案编号:11010802020122 niuxiaotong@pcpop.com 17352615567
未成年举报专区
中国互联网协会会员  联系我们:huangweiwei@itpub.net
感谢所有关心和支持过ChinaUnix的朋友们 转载本站内容请注明原作者名及出处

清除 Cookies - ChinaUnix - Archiver - WAP - TOP