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求生物信息的高人，关于碱基分布的画图，bioperl能实现吗，怎么实现？？急！！！ [复制链接]

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1楼 [收藏(0)] [报告]

发表于 2011-04-19 13:45 |只看该作者 |倒序浏览

现在有1000多条启动子序列，现在bioperl中有什么方法可以画类似这样的分布图吗？？

碱基分布.jpg (32.69 KB, 下载次数: 19)

碱基分布.jpg

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2楼 [报告]

发表于 2011-04-19 15:05 |只看该作者

顶，求高手！

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3楼 [报告]

发表于 2011-04-19 15:12 |只看该作者

顶，求高手！

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4楼 [报告]

发表于 2011-04-19 15:22 |只看该作者

顶我自己一个！

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5楼 [报告]

发表于 2011-04-19 15:53 |只看该作者

GC-skew 的介绍和算法可以见

http://gcat.davidson.edu/DGPB/gc_skew/gc_skew.html

这里有个 R 的代码，可以参考

http://r.789695.n4.nabble.com/vi ... rties-td840991.html

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6楼 [报告]

发表于 2011-04-19 16:42 |只看该作者

感谢，我去看看怎么用啊！

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7楼 [报告]

发表于 2011-04-19 16:46 |只看该作者

本帖最后由 aids260 于 2011-04-19 17:02 编辑

回复 5# longbow0

有perl语言的吗？？ r语言没有接触过啊！我这里的启动子序列有1000多条怎么能进行一个整体的组成的分析哪？

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8楼 [报告]

发表于 2011-04-19 17:51 |只看该作者

顶啊，求高手啊

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日期:2015-10-07 06:20:00

9楼 [报告]

发表于 2011-04-20 05:34 |只看该作者

回复 7# aids260

longbow0已经回答的很清楚了吧，赞longbow0～

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10楼 [报告]

发表于 2011-04-20 09:25 |只看该作者

GC-skew 的介绍和算法可以见

这里有个 R 的代码，可以参考
longbow0 发表于 2011-04-19 15:53

高人！

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