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求生物信息的达人，碱基分布的画图，用bioperl能实现吗，怎么实现？上火啊！！！ [复制链接]

aids260

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1楼 [收藏(0)] [报告]
发表于 2011-04-19 21:07 |只看该作者 |倒序浏览
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本帖最后由 aids260 于 2011-05-05 09:42 编辑

现在有1000多条启动子序列，有什么方法可以画类似这样的分布图吗？？（直接求代码（最好是perl的代码）和方法，在下急用，没时间研究了）请达人指点。

碱基分布.jpg (32.69 KB, 下载次数: 54)

碱基分布.jpg

碱基分布.jpg (32.69 KB, 下载次数: 52)

碱基分布.jpg
ununique007

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2楼 [报告]
发表于 2011-04-20 15:17 |只看该作者
试试 GD::Graph
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longbow0

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3楼 [报告]
发表于 2011-04-20 17:33 |只看该作者
选择不同的 window_size 和 step_size，计算出 GC%，然后用 Perl 的 Chart 包产生图形。
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aids260

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4楼 [报告]
发表于 2011-05-05 09:23 |只看该作者
顶一个
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aids260

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5楼 [报告]
发表于 2011-05-05 09:40 |只看该作者
求达人哥！跪求
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iamlimeng

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6楼 [报告]
发表于 2011-05-05 11:13 |只看该作者
用GD模块能画此图，使用很简单，看GD的文档吧
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aids260

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7楼 [报告]
发表于 2011-05-05 11:53 |只看该作者
回复 6# iamlimeng


    哥们会画吗？？能帮个忙吗？
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iamlimeng

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8楼 [报告]
发表于 2011-05-05 12:07 |只看该作者


这是我用GD画的图，我不知道你的图具体是怎样的，我想应该相似吧
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zhlong8

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9楼 [报告]
发表于 2011-05-05 12:14 |只看该作者
4月19日都已经没时间研究了
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aids260

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10楼 [报告]
发表于 2011-05-05 14:22 |只看该作者
回复 9# zhlong8


    我是今天刚刚改的啊
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