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perl数组比较求助 [复制链接]

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发表于 2011-07-06 08:43 |只看该作者 |倒序浏览
各位XDJM:
    小弟在工作上遇到一个困难,请求各位大大帮助一下。谢谢。。。文件格式如下:


SNP_A-4194556        AB        0.016        BB        0.026        AB        0.036        AA        0.115        rs12058711       
SNP_A-4200262        BB        0.045        BB        0.109        BB        0.093        BB        0.243        rs11205411       
SNP_A-2244055        BB        0.049        AB        0.012        BB        0.023        BB        0.049        rs11205401       
SNP_A-2105213        AB        0.006        AB        0.092        AA        0.001        AB        0.037        rs12748771       


文本就是这种格式,主要有4列的,形式如同AA,AB,AB,AA这样的数组,在每行进行比较,如果在某行中,前3个数组的元素相同,而与第4个数组的元素不同,则把这一行的全部内容输入到另一个文本中去。。

用perl编写一下。谢谢啦。

小弟初学PERL,感觉这个思路是这样,但是无法实施到代码上。希望能在各位的帮助下学习一下。。。谢谢

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射手座
日期:2014-10-10 15:59:4715-16赛季CBA联赛之上海
日期:2016-03-03 10:27:14
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发表于 2011-07-06 08:54 |只看该作者
回复 1# 努力学习PERL


    没明白,你指的数组相同是啥?


SNP_A-4194556        AB        0.016        BB        0.026        AB        0.036        AA        0.115        rs12058711      
为例, 你指的是"AB",还是"AB        0.016",还是"0.016"?

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发表于 2011-07-06 08:57 |只看该作者
回复  努力学习PERL


    没明白,你指的数组相同是啥?


SNP_A-4194556        AB        0.01 ...
yinyuemi 发表于 2011-07-06 08:54



    是说的是AB,就单单是AB,BB,AB,AA这样的数组。。。。

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日期:2014-10-10 15:59:4715-16赛季CBA联赛之上海
日期:2016-03-03 10:27:14
4 [报告]
发表于 2011-07-06 09:17 |只看该作者
回复 3# 努力学习PERL


    笨办法:
  1. echo 'SNP_A-4194556        AB        0.016        BB        0.026        AB        0.036        AA        0.115        rs12058711
  2. SNP_A-4200262        BB        0.045        BB        0.109        BB        0.093        AA        0.243        rs11205411
  3. SNP_A-2244055        BB        0.049        AB        0.012        BB        0.023        BB        0.049        rs11205401
  4. SNP_A-2105213        AB        0.006        AB        0.092        AA        0.001        AB        0.037        rs12748771        '|\
  5. perl -alne '{print $_ if($F[1]=~$F[3]&&$F[3]=~$F[5]&&$F[5]!~$F[7])}'
  6. SNP_A-4200262        BB        0.045        BB        0.109        BB        0.093        AA        0.243        rs11205411
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