花了很久搞SGE集群，现将文档详细地整理出来，希望对大家有帮助

heart_eternal

回复  heart_eternal


    楼主，最近我也想搞sge，多多指教！
   之前是安装过测试环境了，就是不知 ...
caixicheng 发表于 2011-08-26 16:56

    还有，我想：SGE本身也就是个作业调度系统吧，能将某个任务分配给集群系统中空闲的核。
    但是，对某个作业而言，仍然是串行的。
    SGE本身办不到并行计算啊
    好像，并行计算需要mpich，还要写专门的并行计算程序
    SGE只能算是作业的并行调度，是作业级的，办不到并行计算

    以上是个人理解，如果不对，欢迎指正啊

    你说的eda，我就不太清楚那是什么

caixicheng

恩，我知道了，之前就试过，好像还要软件支持才行

eda是ic方面的软件

meego2012

回复 1# heart_eternal


    好东西，虽然还没有做过这样的项目，估计以后也会有用。

yjs_sh

sge安装完成后，一般都没有配置并行运行环境。如果要用SGE管理并行应用，需要先配置并行环境，在$SGE/mpi目录下有2个模板，按照模板添加并行环境，然后将这个并行环境和队列关联。这样配置后基本就可以进行并行应用的作业提交了。
一般并行作业都是通过mpi来运行的，可以通过如下命令提交并行作业
qsub -pe mpi 8 job
mpi为并行环境的名字，8为需要的CPU数量，job为运行程序的脚本。
qsub在提交作业的时候会自动在集群中查找合适的机器，并将主机名、CPU数量等一些信息存在内置的变量PE_HOSTFILE文件中。可以对这个变量进行格式变换传给应用程序。
PE_HOSTFILE文件示例：
compute-00   4        all.q@compute-00      UNDEFINED
compute-01   4        all.q@compute-01      UNDEFINED

caixicheng

回复 14# yjs_sh


    很牛啊
   
  请问qsub这个是怎么运行的？
  我有一个疑问，运行qlogin sge会根据负载选择登陆的工作站，那我就要在所有工作站新建这个用户的主目录，或是用nfs解决这个问题
  qsub它是怎么做到的，还是说不用考虑这个问题？

yjs_sh

在SGE里主机分为集中类型：管理主机，提交主机、计算主机
用户只要登录提交主机提交作业即可，具体在哪台计算节点上运行，由SGE自动确定。一般管理主机和提交主机都在同一个节点上。
如果要做并行计算，用户的home目录必须一样，并且用户在所有节点上都一致。
home目录可以通过nfs共享或其他文件系统，比如：GFS、GPFS、Lustre来实现，账户可以通过NIS或LDAP集中管理，不用在每台计算节点上建立用户。

sdkdgzb13

刚出炉的，结合实际操作的，学习了

luyi1983

收藏了 以后请教楼主，，，

guopy007

不错的东西 正计划研究一下

hosthouse

SGE跟分布式的文件系统有什么区别吗？
例如使用了moosefs，还需要使用到SGE？