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关于win下的BioPerl安装 [复制链接]

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15-16赛季CBA联赛之北控
日期:2016-08-05 14:22:52
发表于 2012-08-26 09:18 |显示全部楼层
我在winxp和win7中都尝试了bioperl官网的各种安装方法,以及网上的类似的安装方法,最后都以失败告终,很是郁闷。求在win下成功安装bioperl并正常使用的大侠指导,谢谢。

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CU大牛徽章
日期:2013-04-17 11:46:28CU大牛徽章
日期:2013-04-17 11:46:39
发表于 2012-08-26 11:17 |显示全部楼层
不能用 ppm 或者 cpan 安装么?

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15-16赛季CBA联赛之四川
日期:2018-03-27 11:59:132015年亚洲杯之沙特阿拉伯
日期:2015-04-11 17:31:45天蝎座
日期:2015-03-25 16:56:49双鱼座
日期:2015-03-25 16:56:30摩羯座
日期:2015-03-25 16:56:09巳蛇
日期:2015-03-25 16:55:30卯兔
日期:2015-03-25 16:54:29子鼠
日期:2015-03-25 16:53:59申猴
日期:2015-03-25 16:53:29寅虎
日期:2015-03-25 16:52:29羊年新春福章
日期:2015-03-25 16:51:212015亚冠之布里斯班狮吼
日期:2015-07-13 10:44:56
发表于 2012-08-26 11:55 |显示全部楼层
楼上是复读机

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15-16赛季CBA联赛之北控
日期:2016-08-05 14:22:52
发表于 2012-08-26 13:03 |显示全部楼层
回复 2# cdtits
cpan/ppm是官网推荐的安装方法之一,我试过了,安装失败了!还有Perl Package Manager,  manual installation都试过了,都不行。

   

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发表于 2012-08-26 21:19 |显示全部楼层
1. 下载bioperl程序包,解压。

2. DOS下进入解压所在目录,依次运行“perl build.pl”--"perl build test"---"perl build install".

xp下,应该ok!win 7 不知道。

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15-16赛季CBA联赛之北控
日期:2016-08-05 14:22:52
发表于 2012-08-27 07:52 |显示全部楼层
回复 5# yzhlinscau
这个方法我试过了,结果failed,而且我也装了nmake,

   

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发表于 2012-08-27 09:28 |显示全部楼层
xp:perl,你安装的是active perl 还是straw perl。你可以试试换另一个perl版本,再安装bioperl。

Win 7:先安装strawberryperl,进入DOS命令输入perl -MCPAN -e “install   Bundle::BioPerl”。我试了,可行。安装时,需要管理员的权限。如果安装失败,可以试试强制安装:perl -MCPAN -e “force install   Bundle::BioPerl”。

祝好运!

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发表于 2012-08-27 10:42 |显示全部楼层
失败了 也需要看看失败的原因吧~~   

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发表于 2012-08-27 13:22 |显示全部楼层
win下 active perl用PPM加上bioperl的源后直接就可以安装了,很直接的啊。不晓得你安不上的返回信息是什么。还有希望系统的用户名不是中文吧,有时会对PPM造成影响。

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15-16赛季CBA联赛之北控
日期:2016-08-05 14:22:52
发表于 2012-08-29 11:12 |显示全部楼层
回复 8# xiyoulaoyuanjia

它虽然说won't install without force ,但用了force install 还是返回这个结果。
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