qsub提交perl脚本找不到pm模块

sequencing

遇到一个问题，在命令行里直接运行perl时没有问题，但是放在PBS脚本里提交任务时竟然出错，说Can't locate LWP/Simple.pm in @INC(@INC contains:...... /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8... .)，但它后面列出的@INC包括的目录明明包含perl脚本里用到的模块。
手工在perl脚本开头添加unshift @INC, /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8仍然不行。

请教大家，为什么直接在shell里运行和通过PBS提交会有这样的差别？多谢！

Monox

回复 1# sequencing

原因很简单，因为直接命令行运行和 qsub 提交是在不同节点上运行的。你的问题就在于你用来直接跑程序的节点下有安装相应的 Perl 模块，而你 qsub 上去的那个计算节点没有相应的 Perl 模块。虽然提示的路径是一样的，但是计算节点上的那个路径下并没有你所需要的模块。解决的办法有两个，一个是让管理员上所有的计算节点上标准的路径下安装所有你需要的模块，另一个是把模块安装在你自己有权限写入的可以被计算节点访问到的盘阵（一般来说就是你的工作盘阵），然后把这个安装路径添加到你的脚本里，或者添加到相应的环境变量里（qsub -V 可以把你的环境变量传输到计算节点）。我没辞职前一直都是自己在自己的工作盘阵里安装 Perl 然后把需要的模块安装到自己装的 Perl 的标准路径下，那个 Perl 的版本会比所有节点上的新（节点上一般都使用老掉牙的 Perl 5.8），而且它会自动找我安装的那些模块，而不需要进行任何配制也不需要在脚本里写额外的东西。
   

gaoyang636

楼上说的很全面。
我觉得LZ这个问题应该是你们集群管理人员的业务水平问题，你应该积极向他们反映，让他们也要进步提高