免费注册 查看新帖 |

Chinaunix

  平台 论坛 博客 文库
12下一页
最近访问板块 发新帖
查看: 5143 | 回复: 18
打印 上一主题 下一主题

现在需要编一个数理统计的程序,弄不出来了,求大神帮忙,万分万分感谢!!! [复制链接]

论坛徽章:
1
狮子座
日期:2014-02-25 09:46:33
跳转到指定楼层
1 [收藏(0)] [报告]
发表于 2013-11-17 10:17 |只看该作者 |倒序浏览
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1221:2186        Cluster_29235        XA:Z:Cluster_67972,+589,100M,0;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1221:2186        Cluster_29235        XA:Z:Cluster_67972,-771,100M,1;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1270:2135        Cluster_39664       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1270:2135        Cluster_39664       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1483:2147        Cluster_33745       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1483:2147        Cluster_67963       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1318:2150        Cluster_79602        XA:Z:Cluster_42584,-594,100M,0;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1318:2150        Cluster_79602        XA:Z:Cluster_42584,+409,100M,1;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1383:2209        Cluster_18421       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1383:2209        Cluster_18421               
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1676:2131        Cluster_69157        XA:Z:Cluster_29478,+828,100M,0;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1676:2131        Cluster_69157        XA:Z:Cluster_29478,-1069,100M,0;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1543:2146        Cluster_41540       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1543:2146        Cluster_41540       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1725:2175        Cluster_40792       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1725:2175        Cluster_40789        XA:Z:Cluster_40790,-372,100M,0;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1516:2211        Cluster_6748        XA:Z:Cluster_54877,-968,100M,3;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1516:2211        Cluster_6748        XA:Z:Cluster_54877,+711,100M,0;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1902:2088        Cluster_6876       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1902:2088        Cluster_6876       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1883:2112        *       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1883:2112        *       
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1921:2112        Cluster_42544        XA:Z:Cluster_78702,-3815,24M3D76M,3;Cluster_78704,-1041,2
4M3D76M,3;Cluster_78703,-3794,24M3D76M,3;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1921:2112        Cluster_42544        XA:Z:Cluster_78702,+3629,100M,0;Cluster_78703,+3608,100M,
0;Cluster_78704,+855,100M,0;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1758:2115        Cluster_66929        XA:Z:Cluster_24977,+1407,100M,1;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1758:2115        Cluster_66929        XA:Z:Cluster_24977,-1585,100M,0;
文件是我经过处理的,大体如上,先说明一下这个文件,第一列是序列,每两行是一对,第二列是比对上的染色体,第三列中有的有比对上的染色体,就是那些以“Cluster_*****”格式的,现在需要统计的是,两行两行的读取文件,如果第二列中,每两行的染色体是一样的,就统计这条染色体的数目为一对,两条,最后打印的结果为“染色体    对数    条数”格式的,而且还要考虑第三列中的情况,因为第三列中有的也有染色体,同样要统计其对数跟条数,注意:第二列中如果没有比对上的染色体,其显示的是“*”符号;程序对我来讲比较繁琐,求大神帮忙!!!

论坛徽章:
1
狮子座
日期:2014-02-25 09:46:33
2 [报告]
发表于 2013-11-17 20:55 |只看该作者
大神们都哪里去了~~~

论坛徽章:
5
丑牛
日期:2014-01-21 08:26:26卯兔
日期:2014-03-11 06:37:43天秤座
日期:2014-03-25 08:52:52寅虎
日期:2014-04-19 11:39:48午马
日期:2014-08-06 03:56:58
3 [报告]
发表于 2013-11-18 11:03 |只看该作者
郁闷。我怎么看来看去也看不懂{:2_170:}

论坛徽章:
5
丑牛
日期:2014-01-21 08:26:26卯兔
日期:2014-03-11 06:37:43天秤座
日期:2014-03-25 08:52:52寅虎
日期:2014-04-19 11:39:48午马
日期:2014-08-06 03:56:58
4 [报告]
发表于 2013-11-18 12:40 |只看该作者
lz 应该去学会如何提问

一个简单的例子说明如何提问

http://bbs.chinaunix.net/thread-4111100-1-2.html

论坛徽章:
1
狮子座
日期:2014-02-25 09:46:33
5 [报告]
发表于 2013-11-18 13:35 |只看该作者
之前那个是输入文件,输出文件类似这种格式:
Cluster_61957   1647100 818718
Cluster_9141    1614933 802646
Cluster_30722   907721  451421
Cluster_69535   881255  438249
Cluster_26071   238105  118715
Cluster_40680   225737  110852
Cluster_42542   222271  110920
Cluster_42541   214644  107104
Cluster_6788    181676  90515
Cluster_38806   175830  74981
Cluster_42543   165019  81188
Cluster_40679   164901  81843
第一列就是染色体编号,第二列就是其出现的条数,第三列是其出现的对数,这样讲能明白了吗???回复 3# pitonas


   

论坛徽章:
1
狮子座
日期:2014-02-25 09:46:33
6 [报告]
发表于 2013-11-18 13:47 |只看该作者
输入文件为:
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1221:2186        Cluster_29235        XA:Z:Cluster_67972,+589,100M,0;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1221:2186        Cluster_29235        XA:Z:Cluster_67972,-771,100M,1;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1270:2135        Cluster_39664        
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1270:2135        Cluster_39664
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1883:2112        *        
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1883:2112        *        
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1483:2147        Cluster_29235        
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1483:2147        Cluster_67963               
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1921:2112        Cluster_42544        XA:Z:Cluster_78702,-3815,24M3D76M,3;Cluster_78704,-1041,24M3D76M,3;Cluster_78703,-3794,24M3D76M,3;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1921:2112        Cluster_42544        XA:Z:Cluster_78702,+3629,100M,0;Cluster_78703,+3608,100M,0;Cluster_78704,+855,100M,0;
最后的输出文件类似这样格式:
Cluster_29235     3    1
Cluster_39664     2    1
Cluster_67972     2    1
Cluster_67963     1    0
Cluster_42544     2    1
Cluster_78702     2    1
Cluster_78703     2    1
Cluster_78704     2    1
这样说的话,能明白了吗??????回复 4# pitonas


   

论坛徽章:
5
丑牛
日期:2014-01-21 08:26:26卯兔
日期:2014-03-11 06:37:43天秤座
日期:2014-03-25 08:52:52寅虎
日期:2014-04-19 11:39:48午马
日期:2014-08-06 03:56:58
7 [报告]
发表于 2013-11-18 14:20 |只看该作者
条数,对数
不明白{:2_176:}

论坛徽章:
1
狮子座
日期:2014-02-25 09:46:33
8 [报告]
发表于 2013-11-18 15:32 |只看该作者
好吧
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1221:2186        Cluster_29235        XA:Z:Cluster_67972,+589,100M,0;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1221:2186        Cluster_29235        XA:Z:Cluster_67972,-771,100M,1;
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1483:2147        Cluster_29235        
HWI-ST1106:755:H0V1MADXX:2:1101:1483:2147        Cluster_67963  
在这四行文件中,每两行表示的是一对序列,四行共两对序列,第二行表示的是染色体, Cluster_29235在前两行中出现的次数计算为1对,2条,后两行中其又出现了1条,但是在后两行中,他没有成对出现,所以最后计算 Cluster_29235的次数的时候,计为出现1对,3条;而 Cluster_67963出现的次数为0对,1条; Cluster_67972出现的次数为1对,2条;这样能明白了吗,亲???
回复 7# pitonas


   

论坛徽章:
5
丑牛
日期:2014-01-21 08:26:26卯兔
日期:2014-03-11 06:37:43天秤座
日期:2014-03-25 08:52:52寅虎
日期:2014-04-19 11:39:48午马
日期:2014-08-06 03:56:58
9 [报告]
发表于 2013-11-18 15:54 |只看该作者
亲亲?
x Cluster_1 y
x Cluster_2 y
x Cluster_2 y
x Cluster_3 y
这样输出显示?{:2_169:}

论坛徽章:
1
狮子座
日期:2014-02-25 09:46:33
10 [报告]
发表于 2013-11-18 16:49 |只看该作者
最好是这种格式显示:
Cluster_29235     3    1
Cluster_39664     2    1
Cluster_67972     2    1
Cluster_67963     1    0
Cluster_42544     2    1
Cluster_78702     2    1
Cluster_78703     2    1
Cluster_78704     2    1
第一列表示的是每条染色体,第二列表示的是条数,第三列表示的是对数。。。。。。
回复 9# pitonas


   
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则 发表回复

  

北京盛拓优讯信息技术有限公司. 版权所有 京ICP备16024965号-6 北京市公安局海淀分局网监中心备案编号:11010802020122 niuxiaotong@pcpop.com 17352615567
未成年举报专区
中国互联网协会会员  联系我们:huangweiwei@itpub.net
感谢所有关心和支持过ChinaUnix的朋友们 转载本站内容请注明原作者名及出处

清除 Cookies - ChinaUnix - Archiver - WAP - TOP