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[文本处理] (求教)linux下批处理小程序的问题 [复制链接]

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1 [收藏(0)] [报告]
发表于 2014-03-26 15:18 |只看该作者 |倒序浏览
新手求教:

在使用高斯软件的时候(这是化学中常用软件)
比如说我想同时做出氢分子在多个原子间距值R下的轨道,那么我要用到一个批处理的循环语句来控制变量R。
Gaussian的输入文件如下
%chk=H2.chk
# ub3lyp/6-31g(d) pop=reg geom=nocrowd

H2_orbit

0 1
H
H 1 R

R=0.3

然后我在此目录下建立sh文件,sh文件的程序如下
#!/bin/bash
for R in `*.gjf`
R=0.3
while R<=20
do
g09 < ${R} >
R=`echo "scale=2;$R+0.1"|bc`
done

因为sh不能直接处理小数所以加了bc不知道这里对不?
但是sh这个文件的时候总是报错syntax error near unexpected token `R=0.3'


想请问这是怎么回事(将R改成整数也是同样报错)??
以及这样能实现我的目的吗?

谢谢...

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发表于 2014-03-26 15:45 |只看该作者
for R in `*.gjf`

这里的反引号改成双引号试试?

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发表于 2014-03-26 15:51 |只看该作者
回复 2# seesea2517


    谢谢,不过改成双引号还是同样的问题...

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发表于 2014-03-26 15:56 |只看该作者
回复 2# seesea2517


    我将sh里的R=0.3去掉,没有出现这个错误,但是又说while R《=20出错,而且相同的错误...


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5 [报告]
发表于 2014-03-26 15:57 |只看该作者
回复 1# 常思OL

Didn't see "do" and "done" for "for" function

for ... do ... done   

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发表于 2014-03-26 16:00 |只看该作者
回复 3# 常思OL


    细看一下,好多问题啊。这里整理了一下,另外,while 的比较也是不能用小数比较的。不如你扩大个100倍用整数来处理得了。
  1. #!/bin/bash
  2. for R in "*.gjf"
  3. do
  4.     R=0.3
  5.     while (( R <= 20 ))
  6.     do
  7.         g09 < ${R} >
  8.         R=`echo "scale=2;$R+0.1"|bc`
  9.     done
  10. done
复制代码

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发表于 2014-03-26 16:01 |只看该作者
回复 5# jason680


    for R in `*.gjf`
R=0.3
while R<=20
do
g09 < ${R} >
R=`echo "scale=2;$R+0.1"|bc`
done


for...do...done are there??

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发表于 2014-03-26 16:05 |只看该作者
回复 7# 常思OL

please check again and again
   

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9 [报告]
发表于 2014-03-26 16:15 |只看该作者
回复 8# jason680


    thanks very much that I noticed there must be for/do/done and while/do/done...


however when I modified it, it came out the error  =20: No such file or directory

could you explain it a little more?

Thanks(a beginner)

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发表于 2014-03-26 16:25 |只看该作者
seesea已经说了,
sh的判断里是不支持小数比较的

R初值是0.3,一进判断语句就会报错的
先*100让浮点数变整数再判断
判断的时候用seesea给的句子
或者用这种
while [ $R -le 2000 ]
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