如何实现Linux下选择性删除一些有特征的文件？

大帝亚历山大

我现在有一系列的以.pdb结尾的化学分子的文件(图1)，在这一系列文件中，有些文件（图2）中是有H原子的（每一行的最后一个字母代表原子类型，原子构成分子），有些文件里面（图3）没有H原子的（该分子只有C,S,Cl原子）。可不可以编写一个程序（最好在Linux下写个shell）将列表中的不含H原子的文件删掉啊（因为有上万个分子所以手动很麻烦）？






pdb文件列表.zip (37.55 KB, 下载次数: 6)

2014-04-14 12:36 上传

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linux_c_py_php

这种任务对shell来说太普通了啊。

MMMIX

回复 2# linux_c_py_php


    接下来的问题就该是怎么写啊？或者这个问题的翻译版本，你帮我写个吧。

timespace

不复杂，但也不是举手之劳那么简单，楼主把一部分文件压缩上传了，让人尝试下，只是截图，大家也只好空谈了

井蛙夏虫

grep -l '^HETATM.*H$' *.pdb | xargs rm

大帝亚历山大

我上传了一部分列表里的分子文件，可以实现吗？我是菜鸟啊。。。回复 4# timespace


   

大帝亚历山大

好的，谢谢，我试试~在Linux环境下，这个文件夹中，输入grep -l '^HETATM.*H$' *.pdb | xargs rm这个命令，是吗？回复 5# 井蛙夏虫


   

timespace

回复 5# 井蛙夏虫
看楼主那些文件名格式，有些是shell特殊字符，这么rm了，小心楼主找你拼命


   

井蛙夏虫

回复 7# 大帝亚历山大
测试了一下你的文件，用下面这个
grep -l '^HETATM.*H\s*$' *.pdb | xargs -i -n 1 rm '{}'

   

井蛙夏虫

回复 8# timespace
实验脚本前备份应当是习惯?
LZ的文件名还是gbk编码的