请教简化操作，谢谢！

owwa

请问如何简化以下操作：目的是提取文本中的某行作为标题行并排序。 out1.rar (236 Bytes, 下载次数: 7)

2014-06-17 19:28 上传

点击文件名下载附件

awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{if($1 == "chrom") print $0}' out1.txt >h1.txt
awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{if($1 != "chrom") print $0}' out1.txt >h2.txt
cat h1.txt h2.txt > h3.txt
(head -n 1 h3.txt && tail -n +2 h3.txt | sort -k1,1 -k2,2n) > last.txt

谢谢。

Herowinter

回复 1# owwa
无法打开rar，爱莫能助了。。。
   

owwa

回复 2# Herowinter

多谢，其实文本很简单:

chr1        13        14        +        0        1        0        2        0.05        19
chr1        33        34        +        0        1        0        1        0        17
chr1        34        35        -                0        0        1        0        24
chr1        210        211        +        0        1        0        2        0        20
chrom        chromstart        chromend        strand        o1        o2        p1        p2        q1        q2
chr1        211        212        -                0        0        1        0.09        23
chr1        217        218        -                0        0        1        0        23
chr1        231        232        +        0        1        0        2        0        20
chr1        232        233        -                0        0        1        0        24
chr1        253        254        -                0        0        1        0        23
chr1        363        364        -        0        21        0        11        0        8

Herowinter

回复 1# owwa

1. awk '$1!="chrom"{a[++m]=$0;next} {b[++n]=$0} END{for(i=1;i<=m;i++)print a[i];for(i=1;i<=n;i++)print b[i]}' out1.txt|sort -k1,1 -k2,2n
   
2. chr1        13        14        +        0        1        0        2        0.05        19
   
3. chr1        33        34        +        0        1        0        1        0        17
   
4. chr1        34        35        -                0        0        1        0        24
   
5. chr1        210        211        +        0        1        0        2        0        20
   
6. chr1        211        212        -                0        0        1        0.09        23
   
7. chr1        217        218        -                0        0        1        0        23
   
8. chr1        231        232        +        0        1        0        2        0        20
   
9. chr1        232        233        -                0        0        1        0        24
   
10. chr1        253        254        -                0        0        1        0        23
    
11. chr1        363        364        -        0        21        0        11        0        8
    
12. chrom        chromstart        chromend        strand        o1        o2        p1        p2        q1        q2

复制代码

owwa

回复 4# Herowinter

呵呵，谢谢，小复杂。

Herowinter

回复 5# owwa
我觉得我2了，我以为你要保持文本本来的出现顺序，
好像直接排序就可以了？这样好像和你的last.txt的结果
也一样？

1. sort -k1,1 -k2,2n out1.txt
   
2. chr1        13        14        +        0        1        0        2        0.05        19
   
3. chr1        33        34        +        0        1        0        1        0        17
   
4. chr1        34        35        -                0        0        1        0        24
   
5. chr1        210        211        +        0        1        0        2        0        20
   
6. chr1        211        212        -                0        0        1        0.09        23
   
7. chr1        217        218        -                0        0        1        0        23
   
8. chr1        231        232        +        0        1        0        2        0        20
   
9. chr1        232        233        -                0        0        1        0        24
   
10. chr1        253        254        -                0        0        1        0        23
    
11. chr1        363        364        -        0        21        0        11        0        8
    
12. chrom        chromstart        chromend        strand        o1        o2        p1        p2        q1        q2

复制代码

owwa

回复 6# Herowinter

希望是此行作为标题行：
12.chrom        chromstart        chromend        strand        o1        o2        p1        p2        q1        q2


   

owwa

回复 6# Herowinter

直接排序不行的，因为还有很多很多不同的行，只是希望提取其中以chrom开头的行作为标题行。
   

Herowinter

回复 7# owwa
这样？

1. awk '$1=="chrom"{a[++m]=$0;next} {b[++n]=$0} END{for(i=1;i<=m;i++)print a[i];for(i=1;i<=n;i++)print b[i]|"sort -k1,1 -k2,2n"}' out1.txt
   
2. chrom        chromstart        chromend        strand        o1        o2        p1        p2        q1        q2
   
3. chr1        13        14        +        0        1        0        2        0.05        19
   
4. chr1        33        34        +        0        1        0        1        0        17
   
5. chr1        34        35        -                0        0        1        0        24
   
6. chr1        210        211        +        0        1        0        2        0        20
   
7. chr1        211        212        -                0        0        1        0.09        23
   
8. chr1        217        218        -                0        0        1        0        23
   
9. chr1        231        232        +        0        1        0        2        0        20
   
10. chr1        232        233        -                0        0        1        0        24
    
11. chr1        253        254        -                0        0        1        0        23
    
12. chr1        363        364        -        0        21        0        11        0        8

复制代码

PS: 你现在的out1.txt基本已经按2，3列排好序了。
   

owwa

回复 9# Herowinter

多谢兄弟! 略显复杂。