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新手求助!!!这段代码怎么写 [复制链接]

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发表于 2014-09-16 20:15 |显示全部楼层
新手,老师只给了这段话,就让我写代码,完全不会啊,有没有大神帮我看看怎么写?
如下:
首先,程序要将括号树读进来,然后,依次输出树的分支。比如一个树包括A,B,C,D四个基因,那么我们要先读进树,然后按照年轻到古老依次输出,基因间距离越大,两基因分开越早,意味着他们分开的越古老。对于基因A来说按照年轻到古老,依次成对输出,对于B来说按照年轻到古老依次输出........直到将树中包含的所有基因都这样循环输出,注意每个基因输出一行,一行中就是一对一对的基因,一对基因就是一个分支。
谢谢啦!

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日期:2013-09-30 08:51:28技术图书徽章
日期:2013-12-11 09:26:39白羊座
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日期:2017-08-14 23:24:57
发表于 2014-09-16 20:58 |显示全部楼层
不要用语言描述,放个例子,然后告诉大家你想做成什么样的。比这样描述好多了。。

虽然我知道你是想做读进化树的东西,但是非生物专业的不知道啊··

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程序设计版块每日发帖之星
日期:2015-10-07 06:20:00
发表于 2014-09-16 22:17 |显示全部楼层
Newick format?

(A:0.1,B:0.2,(C:0.3,D:0.4):0.5);       distances and leaf names

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日期:2015-06-16 22:20:002015亚冠之塔什干火车头
日期:2015-06-20 23:28:22
发表于 2014-09-17 11:38 |显示全部楼层
不——明——觉——厉

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发表于 2014-09-17 16:37 |显示全部楼层
有什么生物软件可以读Newick format这个格式嘛  回复 3# chenhao392


   

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发表于 2014-09-17 17:56 |显示全部楼层
mega就能读啊,我们这里有人写了一个相关的newick模块,很强大回复 5# xiumu2280


   

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发表于 2014-09-17 20:25 |显示全部楼层
能不能贴出来看看~~~回复 6# felix0608


   

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发表于 2014-09-17 20:53 |显示全部楼层
发现bioperl里面就有··

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丑牛
日期:2014-01-21 08:26:26卯兔
日期:2014-03-11 06:37:43天秤座
日期:2014-03-25 08:52:52寅虎
日期:2014-04-19 11:39:48午马
日期:2014-08-06 03:56:58
发表于 2014-09-17 21:34 |显示全部楼层

我看过苹果树,也吃过上百万,上千万个牛逼的苹果。
但是有一点是肯定的,
话说进化树这个东西,总而言之,我就从来不知道什么进化树。{:2_176:}

my $师傅;

能不能贴出个 DATA,然后贴出个输出
我想练习写这个题。
回复 2# xiumu2280


   

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射手座
日期:2014-10-10 15:59:4715-16赛季CBA联赛之上海
日期:2016-03-03 10:27:14
发表于 2014-09-18 19:18 |显示全部楼层
回复 9# pitonas


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