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常见的原因：
1. 服务器超时，比如说在一个脚本里连接上服务器后进行了一些数据库操作后，就开始冷落了数据库，执行起其他一些非数据库操作的耗时操作，数据库等啊等等啊等，结果超时了，只好关闭连接。如果是这个原因，请加大wait_timeout。
2. 因为SQL语句太长所致，比如插入一个BLOB列，或者用一条INSERT语句同时插入很多行，因为SQL太长，数据库可能就无法接收到完整的 SQL，结果数据库就会觉得客户端出错了，从而关闭连接。如果是这个原因，请加大max_allowed_packet。
MySQL在连接超时这块的参数如下
root@(none) 09:24:51>show variables like '%out%'; +------------------------------+----------+ | Variable_name | Value | +------------------------------+----------+ | connect_timeout | 10 | | delayed_insert_timeout | 300 | | handlersocket_timeout | 300 | | handlersocket_wrlock_timeout | 12 | | innodb_lock_wait_timeout | 100 | | innodb_rollback_on_timeout | OFF | | interactive_timeout | 28800 | | lock_wait_timeout | 31536000 | | log_output | FILE | | net_read_timeout | 30 | | net_write_timeout | 60 | | slave_net_timeout | 3600 | | wait_timeout | 28800 | +------------------------------+----------+ 把PHP连接MySQL的连接方式从长连接改成了短连接，就再没出现了。
1.MySQL服务器的wait_timeout参数为默认的28800秒，即8小时。该参数的意思是MySQL等待睡眠的连接的持续时间，如果超过8小时不活动，MySQL就会关闭这个连接。这个参数可以动态修改，但这个参数是session级别的，需要应用重新建立连接获取这个变量值才会生效。
2.PHP的默认php.ini里面，default_socket_timeout参数是默认60s.default_socket_timeout参数的意思是socket超时为60s。 官方解释
3.在MySQL的官方文档里面，有专门的章节介绍MySQL Server has gone away。但并没有提及到客户端本身也会有超时机制，以前曾经试过把wait_timeout设置为1年，但App还是继续出现MySQL server has gone away的错误。
4.在PHP程序里面，如果php.ini修改起来不方便，可以以下代码来尝试解决。
ini_set('mysql.connect_timeout', 300); ini_set('default_socket_timeout', 300); 在ini_set后，可以用ini_get来验证参数设置适合符合预期。
参考资料
1. MySQL server has gone away – in exactly 60 seconds
2. MySQL server has gone away
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发表于 2014-10-15 13:53
