免费注册 查看新帖 |

Chinaunix

  平台 论坛 博客 文库
12下一页
最近访问板块 发新帖
查看: 3049 | 回复: 10

[文本处理] 批量处理文件问题 [复制链接]

论坛徽章:
0
发表于 2014-10-22 17:04 |显示全部楼层
本帖最后由 husong0811 于 2014-10-23 09:12 编辑
  1. awk '/^HETATM/{c=a[$3]?a[$3]:" ";a[$3]++;$0=sprintf("%s%-3s%s",substr($0,1,14),c,substr($0,18))}1' FILE
复制代码
请问如何写一个脚本让这个命令对一个文件夹内的所有文件都执行

sed.zip

11.19 KB, 下载次数: 13

论坛徽章:
5
未羊
日期:2014-08-04 16:15:21天秤座
日期:2014-08-13 13:52:372015年辞旧岁徽章
日期:2015-03-03 16:54:152015年迎新春徽章
日期:2015-03-04 09:56:112015亚冠之浦和红钻
日期:2015-06-29 15:30:48
发表于 2014-10-23 09:17 |显示全部楼层
  1. command /path/ab-*.pdb
复制代码

论坛徽章:
0
发表于 2014-10-23 09:34 |显示全部楼层
回复 2# dn833


   那怎么将结果保存下来,覆盖源文件或保存到其他文件夹都行

论坛徽章:
3
天蝎座
日期:2013-12-10 19:37:11酉鸡
日期:2014-08-04 20:05:38双鱼座
日期:2014-08-09 21:53:54
发表于 2014-10-23 09:54 |显示全部楼层
回复 3# husong0811


    我有个比较原始的方法,使用shell当中的for循环

  1. for x in *.pdb; do awk '/^HETATM/{c=a[$3]?a[$3]:" ";a[$3]++;$0=sprintf("%s%-3s%s",substr($0,1,14),c,substr($0,18))}1' "$x" > "$x.done"; done
复制代码
每个文件处理过后,都保存到 "源文件文件名.done"文件当中去

论坛徽章:
5
未羊
日期:2014-08-04 16:15:21天秤座
日期:2014-08-13 13:52:372015年辞旧岁徽章
日期:2015-03-03 16:54:152015年迎新春徽章
日期:2015-03-04 09:56:112015亚冠之浦和红钻
日期:2015-06-29 15:30:48
发表于 2014-10-23 10:06 |显示全部楼层
  1. [root@FILE_SHARE tmp]# cat b
  2. 1 1
  3. 2 2
  4. 3 3
  5. 4 4
  6. 5 5
  7. 6 6
  8. 7 7
  9. 8 8
  10. 9 9
  11. 10 10
  12. [root@FILE_SHARE tmp]# awk '{print $0,$0 > "b"}' b
  13. [root@FILE_SHARE tmp]# cat b
  14. 1 1 1 1
  15. 2 2 2 2
  16. 3 3 3 3
  17. 4 4 4 4
  18. 5 5 5 5
  19. 6 6 6 6
  20. 7 7 7 7
  21. 8 8 8 8
  22. 9 9 9 9
  23. 10 10 10 10
复制代码
此方法慎用,没的后悔药哦~~~

论坛徽章:
0
发表于 2014-10-23 10:13 |显示全部楼层
回复 4# 欧阳西风

那如果要直接覆盖源文件把哪里改一下
   

论坛徽章:
3
天蝎座
日期:2013-12-10 19:37:11酉鸡
日期:2014-08-04 20:05:38双鱼座
日期:2014-08-09 21:53:54
发表于 2014-10-23 10:20 |显示全部楼层
本帖最后由 欧阳西风 于 2014-10-23 10:24 编辑

回复 6# husong0811


    可以将
"$x" > "$x.done"
改为
"$x" 1<>"$x"


不过不推荐直接覆盖源文件,有比较大的风险。

论坛徽章:
0
发表于 2014-10-23 10:56 |显示全部楼层
回复 7# 欧阳西风


   谢啦

论坛徽章:
0
发表于 2014-10-23 10:58 |显示全部楼层
回复 5# dn833


   谢啦

论坛徽章:
33
ChinaUnix元老
日期:2015-02-02 08:55:39CU十四周年纪念徽章
日期:2019-08-20 08:30:3720周年集字徽章-周	
日期:2020-10-28 14:13:3020周年集字徽章-20	
日期:2020-10-28 14:04:3019周年集字徽章-CU
日期:2019-09-08 23:26:2519周年集字徽章-19
日期:2019-08-27 13:31:262016科比退役纪念章
日期:2022-04-24 14:33:24
发表于 2014-10-23 12:51 |显示全部楼层
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则 发表回复

  

北京盛拓优讯信息技术有限公司. 版权所有 京ICP备16024965号-6 北京市公安局海淀分局网监中心备案编号:11010802020122 niuxiaotong@pcpop.com 17352615567
未成年举报专区
中国互联网协会会员  联系我们:huangweiwei@itpub.net
感谢所有关心和支持过ChinaUnix的朋友们 转载本站内容请注明原作者名及出处

清除 Cookies - ChinaUnix - Archiver - WAP - TOP