将表头的每一个ID编号替换为各自对应的名称

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回复 9# Agnes_ss


    awk的语法，请看精华帖吧

   大致说一下，NR==FNR表示这段处理的是前一个文本，里面a[xx]=yyy表示生成哈希数组a，其中xx下标的元素值为yyy
    后面就是判断，如果a[xx]存在，则用yyy来替换xx

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1. awk -vOFS=\t xxxx

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    输出结果没变，还是用空格分割的。。

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    把你执行的语句贴一下吧

   如果输出不变，可以在后面那段加一个NF+=0

Agnes_ss

1. qiime@qiime-VirtualBox:~/Agnes/test$ awk 'NR==FNR{a[$1]=$2;next}FNR==1{for(i=2;i<=NF;i++){if(a[$i])$i=a[$i]}}1' b a > c
   
2. qiime@qiime-VirtualBox:~/Agnes/test$ awk -vOFS=\t xxxx c
   
3. qiime@qiime-VirtualBox:~/Agnes/test$ head c
   
4. OTU ID SGM2 CL2 SGM1 DDZ1 LSM2 LSM3 XL3 DZ1 DZ3 CL1 DZ6 HJH1 DWZD3 WLJ2 QLQ3 DWZD2 taxonomy
   
5. OTU1        1        0        35        0        0        0        0        0        0        0        21        0        0        0        0        0        d__Archaea; p__Euryarchaeota
   
6. OTU2        0        2        0        0        5        0        12        0        0        0        0        0        7        0        0        0        d__Archaea; p__Euryarchaeota
   

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    大哥你太有才了。。。。

1. awk -vOFS='\t' 'NR==FNR{a[$1]=$2;next}FNR==1{for(i=2;i<=NF;i++){if(a[$i])$i=a[$i]}}1' b a

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Agnes_ss

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    我啥都不懂。。

Agnes_ss

回复 16# bulletmarquis


    但是第一个OTU与ID之间的空格要保留啊

bulletmarquis

回复 18# Agnes_ss


    如果你的原始文本就是以TAB间隔的话，可以这么写

1. awk -vFS='\t' -vOFS='\t' 'NR==FNR{a[$1]=$2;next}FNR==1{for(i=2;i<=NF;i++){if(a[$i])$i=a[$i]}}1' b a

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    这样的话，就是原来的表格，编号没有被名称替换