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检测BLAST软件是否安装 [复制链接]

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1 [收藏(0)] [报告]
发表于 2014-12-26 10:19 |只看该作者 |倒序浏览
本帖最后由 pony2001mx 于 2014-12-26 10:20 编辑

大家好:
我在perl程序里检测BLAST软件是否安装上,用到下面命令,为什么不输出ERROR: blast not installed信息? (注:BLAST没有安装)
谢谢指点迷津!


check_blast();

sub check_blast {
    (open (my $BLAST_command, "blastn -h |")) || print STDERR "ERROR: blast not installed";
    close $BLAST_command;
}

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发表于 2014-12-26 22:14 |只看该作者
  1. #!perl;
  2. use strict;

  3. my $a=`blastall`;

  4. unless ($a=~/blast/){
  5.         print STDERR "ERROR: blast not installed";
  6. }
复制代码
Windows下测试可行……

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发表于 2014-12-27 10:44 |只看该作者
谢谢b114213903!
回复 2# b114213903


   
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