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perl 重命名ID的代码 [复制链接]

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日期:2015-09-14 06:20:00
发表于 2015-07-30 19:12 |显示全部楼层
回复 10# b114213903


    我就知道有对应的模块……

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发表于 2015-07-31 13:39 |显示全部楼层
回复 11# MMMIX


    BioPerl模块,功能还是很强大的!

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发表于 2015-07-31 13:52 |显示全部楼层
回复 12# b114213903


    关键是这个东西它有(专业)针对性,其他一些解决方法怎么看都像是 hackish

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巳蛇
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发表于 2015-07-31 14:41 |显示全部楼层
回复 13# MMMIX


    嗯,您说的很对!这个模块主要就是生物信息员需要用的功能,序列格式转换、网络数据库获取数据、数据处理和分析,报告出图一系列的模块包,很给力!但需要时间学习,甚至安装都有问题,呵呵

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发表于 2016-09-10 11:36 |显示全部楼层
  1. perl -nle 'print /\A>/ ? ++$n : $_' f
复制代码

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发表于 2016-09-11 19:51 |显示全部楼层
本帖最后由 华小飞_Perl 于 2016-09-12 14:59 编辑

来一个~
  1. #!/usr/bin/perl

  2. use warnings;
  3. use strict;

  4. my $i;
  5. while (<>) {
  6.         chomp;
  7.         if (/^>/m) {
  8.                 $i++;
  9.                 print ">seq", $i, "\n";
  10.         }
  11.         print $_, "\n";
  12. }
复制代码
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