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[已解决]如何将名字相近的文件合并?,谢谢~ [复制链接]

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发表于 2015-11-22 21:09 |只看该作者 |倒序浏览
本帖最后由 baiguihuajl 于 2015-11-23 11:05 编辑

我有很多mzML文件,要将相近名字的文件合并:
例如文件名如下:
TCGA_good_117C_BI_f01.mzML
TCGA_good_117C_BI_f02.mzML
TCGA_good_117C_BI_f03.mzML
TCGA_good_117C_BI_fA.mzML
TCGA_uaigi_117C_BI_f01.mzML
TCGA_uaigi_117C_BI_f02.mzML
TCGA_uaigi_117C_BI_f03.mzML
TCGA_uaigi_117C_BI_fA.mzML
......
我想将
TCGA_good_117C_BI_f01.mzML
TCGA_good_117C_BI_f02.mzML
TCGA_good_117C_BI_f03.mzML
TCGA_good_117C_BI_fA.mzML
合并为
TCGA_good_117C.mzML

TCGA_uaigi_117C_BI_f01.mzML
TCGA_uaigi_117C_BI_f02.mzML
TCGA_uaigi_117C_BI_f03.mzML
TCGA_uaigi_117C_BI_fA.mzML
合并为
TCGA_uaigi_117C.mzML
程序应该怎么写。
我先ls>1.txt,得到所有文件的名字,再写了一个程序
  1. #user/bin/perl
  2. open(F1,"1.txt");
  3. while(<F1>){
  4.         chomp;
  5.         $name=~/^TCGA(.*)117C$/;
  6.         `cat $_.mzML >> name.mzML`;
  7. }
  8. close(F1);
复制代码
为什么得不到结果,求指教,谢谢~~~

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日期:2015-12-16 09:17:4315-16赛季CBA联赛之广夏
日期:2016-04-05 11:56:15
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发表于 2015-11-23 08:52 |只看该作者
$name=~/^TCGA(.*)117C$/;    #这个是匹配117C结尾的文件名,所以没结果
然后还需要对$1进行一个判断,最后system("...");把文件合并

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丑牛
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日期:2016-07-06 12:19:55
3 [报告]
发表于 2015-11-23 09:58 |只看该作者
不知道这样行不行
  1. #user/bin/perl
  2. open(F1,"1.txt");
  3. while(<F1>){
  4.         chomp;
  5.         ($name) = $_ =~ /^(TCGA.*117C)/ ;
  6.         `cat $_ >> $name.mzML`;
  7. }
  8. close(F1);
复制代码

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发表于 2015-11-23 11:04 |只看该作者
  1. #user/bin/perl
  2. open(F1,"1.txt");
  3. while(<F1>){
  4.         chomp;
  5.         @a=split('_',$_);
  6.         $name=$a[1];
  7.         `cat $_ >> $name.mzML`;        
  8. }
  9. close(F1);
复制代码
这样就可以了,谢谢大家哈~~~~
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