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[文本处理] shell脚本查找 [复制链接]

litter_kid

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15-16赛季CBA联赛之佛山 日期:2016-07-03 00:10:20
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1楼 [收藏(0)] [报告]
发表于 2016-07-04 16:25 |只看该作者 |倒序浏览
我想通过shell脚本打开一个文件得到特殊字符，如文件aa内容如下：
XP_006715644.1
XP_011513602.1
NP_001129603.1
XP_011514370.1
XP_011546663.1
NP_004846.4
到另一个文件中去找出包含特殊字符的所有行，如：
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99349107        99349213        .       -       0       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99342898        99343033        .       -       1       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99333351        99333547        .       -       0       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99323444        99323667        .       -       1       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99291704        99291820        .       -       2       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99281164        99281453        .       -       2       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
.
..
...等等
求大神支招！谢谢各位了。
product, failed
moperyblue

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15-16赛季CBA联赛之八一 日期:2016-02-22 19:10:4215-16赛季CBA联赛之深圳 日期:2016-12-01 10:34:0415-16赛季CBA联赛之新疆 日期:2016-12-07 10:24:2915-16赛季CBA联赛之同曦 日期:2016-12-15 12:06:43CU十四周年纪念徽章 日期:2016-12-18 13:03:4415-16赛季CBA联赛之吉林 日期:2017-01-03 15:52:2515-16赛季CBA联赛之辽宁 日期:2017-01-04 14:58:2415-16赛季CBA联赛之辽宁 日期:2017-01-15 09:42:512016科比退役纪念章 日期:2017-02-06 17:21:50黑曼巴 日期:2017-02-10 15:46:1215-16赛季CBA联赛之上海 日期:2017-03-18 10:14:5415-16赛季CBA联赛之青岛 日期:2017-03-18 22:00:44
2楼 [报告]
发表于 2016-07-04 16:36 |只看该作者
本帖最后由 moperyblue 于 2016-07-04 16:39 编辑
  1. cat aa2
复制代码
Name=XP_006715644.1
Name=XP_011513602.1
Name=NP_001129603.1
Name=XP_011514370.1
Name=XP_011546663.1
Name=NP_004846.4
  1. grep -Ff aa2 file
复制代码
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cypxx2003

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3楼 [报告]
发表于 2016-07-04 16:45 |只看该作者
sed -e “/查找字符/d” aa
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litter_kid

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15-16赛季CBA联赛之佛山 日期:2016-07-03 00:10:20
4楼 [报告]
发表于 2016-07-04 17:31 |只看该作者
回复 2# moperyblue
谢谢咯，大神

   
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litter_kid

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15-16赛季CBA联赛之佛山 日期:2016-07-03 00:10:20
5楼 [报告]
发表于 2016-07-04 17:31 |只看该作者
回复 3# cypxx2003
谢谢咯

   
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sunzhiguolu

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程序设计版块每周发帖之星 日期:2016-04-08 00:41:33操作系统版块每日发帖之星 日期:2015-09-02 06:20:00每日论坛发贴之星 日期:2015-09-02 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-04 06:20:00每日论坛发贴之星 日期:2015-09-04 06:20:00每周论坛发贴之星 日期:2015-09-06 22:22:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-09 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-19 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-20 06:20:00每日论坛发贴之星 日期:2015-09-20 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-22 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2015-09-24 06:20:00
6楼 [报告]
发表于 2016-07-04 20:56 |只看该作者
本帖最后由 sunzhiguolu 于 2016-07-04 20:56 编辑

试下,
  1. perl -F/Name=/ -nle 'if(@ARGV){$h{$_}=1;next}print if(do{($k)=$F[1]=~/([^;]+)/;$h{$k}})' a b
复制代码
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99349107        99349213        .       -       0       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99342898        99343033        .       -       1       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99333351        99333547        .       -       0       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99323444        99323667        .       -       1       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99291704        99291820        .       -       2       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
NC_000006.12    Gnomon  CDS     99281164        99281453        .       -       2       ID=cds32886;Parent=rna48129;Dbxref=GeneID:84553,Genbank:XP_006715644.1,HGNC:HGNC:20742,HPRD:12866;Name=XP_006715644.1;gbkey=CDS;gene=FAXC;product=failed axon connections homolog isoform X1;protein_id=XP_006715644.1
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ll104567

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15-16赛季CBA联赛之同曦 日期:2016-06-11 19:22:4115-16赛季CBA联赛之深圳 日期:2020-05-31 16:13:5615-16赛季CBA联赛之同曦 日期:2020-01-28 12:42:47每日论坛发贴之星 日期:2016-08-09 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2016-08-09 06:20:00每日论坛发贴之星 日期:2016-07-12 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2016-07-12 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2016-07-06 06:20:00程序设计版块每日发帖之星 日期:2016-07-04 06:20:0015-16赛季CBA联赛之佛山 日期:2021-02-26 09:33:41
7楼 [报告]
发表于 2016-07-05 18:37 |只看该作者
grep -f file1 file2

OR

awk 'NR==FNR{b=NR;a[b]=$0}NR!=FNR{for(i=1;i<=b;i++){if($0~/a[i]/)print;break}}' file1 file2

file1即关键字文件
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