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查看: 939 | 回复: 3

[文本处理] 关于一个shell命令的问题 [复制链接]

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发表于 2016-07-28 09:28 |显示全部楼层
大家好:

我有一个文件如下(第一列是gene ID, 第二列是值)。我需要设定不同的阈值,比如1,2,3,4,5,把基因归类, 产生不同文件。

gene1  3
gene2  4
gene3  2.5
gene4  1.2
...


我用以下命令不行。
  1. for i in 1 2 3 4 5; do perl -ne '@a=split; print if $a[1] <= $i'  > $i; done
复制代码
好像shell用的变量i, 在perl命令里不认,请教高手怎么办? 谢谢!

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摩羯座
日期:2014-11-26 18:59:452015亚冠之浦和红钻
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日期:2017-02-27 20:41:19
发表于 2016-07-28 09:51 |显示全部楼层
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

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发表于 2016-07-28 10:17 |显示全部楼层
本帖最后由 pony2001mx 于 2016-07-28 10:26 编辑

谢谢回复!  我能不能再请教一下, 为什么用双引号?   有问什么加\ (我发现不加\,输出的文件什么也没有)?   非常谢谢!

求职 : 技术支持/维
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发表于 2016-07-28 10:22 |显示全部楼层
  1. #!/usr/bin/ksh
  2. for i in {1..5}
  3. do
  4.         while read -r line
  5.         do
  6.                 if ((${line##* }<=$i))
  7.                 then
  8.                         print $line >>$i
  9.                 fi
  10.         done<file
  11. done
复制代码
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