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确定文件是否为fastq格式 [复制链接]

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发表于 2017-05-12 10:05 |显示全部楼层
perl新手求各位大神指导,谢谢!问题是这样的:
读取input.txt文件,如果不符合fastq格式,输出不符合格式要求的行数。

input.txt文件的部分数据为:


@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1117:14185#0/1
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1117:14185#0/1
__`f__caY[\_]Z_`]ZZZ_]]]Z_Z_ZZ__V\
@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1161:14177#0/1
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1161:14177#0/1
BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1193:14175#0/1
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1193:14175#0/1
BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1227:14171#0/1
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1227:14171#0/1
@BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
@ILLUMINA-B8E12E:8:1:1257:12697#0/1
AAAAAAAAAGAAAAAAGGAAAAGAGGAGGTAATG
+ILLUMINA-B8E12E:8:1:1257:12697#0/1
BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB




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