免费注册 查看新帖 |

ChinaUnix.net

  平台 论坛 博客 文库
最近访问板块 发新帖
查看: 2298 | 回复: 1

关于Perl根据相同列合并N个文件的内容 [复制链接]

论坛徽章:
0
发表于 2019-01-05 14:31 |显示全部楼层
大家好,请教一个问题!望大家指点迷津...1.前提:在一个目录下有N个文件(文件类型一致),且每一个文件中都有两列,格式如下:
假设这是第一个文件的内容:
ID       value1
gene1  1
gene2  2
gene3  3
..
..
2.目的: 为了将这N个文件的内容根据相同ID(即第一列)合并在一起,最终格式是:
ID       value1 value2 .......valueN
gene1  1       2      ......        1
gene2  2       4      ......        10
gene3  3       6      ......        12
..        ..       ..      ......         ..
..        ..       ..      ......         ..

3.大体思路:是第一个文件和第二个文件比,第二个文件和第三个文件比,以此类推
for my $j(0 .. @files2-1){
        if(-e "$files2[$j]"){
                open my $input,$files2[$j] or (die "$!");
        while(<$input>){
            chomp;
            my($id1,$value1)=split/\t/;
            $hash{$id1}=$value1;
        }
    }
    if(-e "$files2[$j+1]"){
        open my $input2,$files2[$j+1] or (die "$!");
        while(<$input2>){
            chomp;
            my($id2,$value2)=(split/\t/,$_);
            if(exists ...){
                  print "$id2\t$hash{$id1}\t$value2\n"; 这个弊端就是只能得到两列
            }

        }
}
该如何才能得到在前一轮输出的列后面继续呢!
谢谢大家了!

论坛徽章:
0
发表于 2019-02-10 23:42 |显示全部楼层
本帖最后由 hztj2005 于 2019-02-14 20:47 编辑

这个代码其实很简单,对于每个文件,用哈希key读出已有的value,把新文件的valueN拼接在后面,再写回哈希表。
全部文件处理完毕,输出哈希表就可以了。
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则 发表回复

基于案例的 SQL 优化实战训练营

讲师:中电福富特级专家梁敬彬,参与本次课程培训,你将收获:
1. 能编写出较为高效的 SQL;
2. 能解决70%以上的数据库常见优化问题;
3. 能得到老师提供的高效的相关工具和解决方案;
4. 能举一反三,收获不仅仅是 SQL 优化。
现在购票享受8.8折优惠!
----------------------------------------
优惠时间:2019年3月20日前

大会官网>>
  

北京盛拓优讯信息技术有限公司. 版权所有 16024965号-6 北京市公安局海淀分局网监中心备案编号:11010802020122
中国互联网协会会员  联系我们:huangweiwei@it168.com
感谢所有关心和支持过ChinaUnix的朋友们 转载本站内容请注明原作者名及出处

清除 Cookies - ChinaUnix - Archiver - WAP - TOP