免费注册 查看新帖 |

ChinaUnix.net

  平台 论坛 博客 文库
论坛 程序设计 Shell shell
最近访问板块 发新帖
查看: 403 | 回复: 1

[文本处理] shell [复制链接]

论坛徽章:
0
发表于 2019-05-14 23:46 |显示全部楼层
大家好,我现在有一个文件是基因组的长度信息,现在想将该信息分割成20bp的片段,原始文件如下:
chr1        249250621
chr2        243199373
chr3        198022430
chr4        191154276
chr5        180915260

结果文件预期为分割成以20 长度为单位 的文件如下:
chr1 0 20
chr1 10 30
chr1 20 40
chr1 30 50
chr1 40 60
chr1 50 70
...
期待各位大神的指教,谢谢!


论坛徽章:
5
2016科比退役纪念章
日期:2018-10-24 08:24:0115-16赛季CBA联赛之北控
日期:2019-03-12 14:34:562016科比退役纪念章
日期:2019-04-01 10:33:0915-16赛季CBA联赛之山东
日期:2019-04-17 12:46:3215-16赛季CBA联赛之广夏
日期:2019-05-09 16:40:40
发表于 2019-05-15 11:50 |显示全部楼层
以10为间隔一直打印到2亿多?  行是行的,估计出来的文件没有2,3个GB是放不下的。
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则 发表回复

基于案例的 SQL 优化实战训练营

讲师:中电福富特级专家梁敬彬,参与本次课程培训,你将收获:
1. 能编写出较为高效的 SQL;
2. 能解决70%以上的数据库常见优化问题;
3. 能得到老师提供的高效的相关工具和解决方案;
4. 能举一反三,收获不仅仅是 SQL 优化。
现在购票享受8.8折优惠!
----------------------------------------
优惠时间:2019年3月20日前

大会官网>>
  

北京盛拓优讯信息技术有限公司. 版权所有 16024965号-6 北京市公安局海淀分局网监中心备案编号:11010802020122
中国互联网协会会员  联系我们:huangweiwei@it168.com
感谢所有关心和支持过ChinaUnix的朋友们 转载本站内容请注明原作者名及出处

清除 Cookies - ChinaUnix - Archiver - WAP - TOP