论坛徽章:: 0

电梯直达

1楼 [收藏(0)] [报告]

发表于 2019-06-21 09:29 |只看该作者 |倒序浏览

大家好，我的A文件是这样的。
>SMED30000001
ATAAAATTTAACATTAATATAAGATTAAAATGTAGAATTACAATATTTTAGTTATGATAATAAGCATGATATTAATTAGA
>SMED30000002
TATTCGACTAGTTTTCAGTGGAAACAAGAATTTAACGAAGAGAAACATGCACAAAACTTTGTTCATTGCAGAAAGATCAG
TGCGTAGATGAATATATTAAGGTAACGC
>SMED30000003
AATTTTTGTTAACATAATCAATAGTACAAGCATTAAGCATAATTATTATCAATATCCTAATTACACATCAATTTTTGTGA
CAATGACATGTCACATTGAGA
>SMED30000004
GCAAAGAAAATTCCCCTTTTTAATTGCAGCCTATAAAATAAAATTAGATCGCGATTTAATAGATATTTTTCCACAGAACT
CTTTCAAAGAATTTCTCTCAGAATATTCATGGCTACAAGTGTTGAAAGTGAAGAAGAATTTCAAGATTTTATTGATGGAA

B文件是这样的
SMED30000001 FTO
SMED30000002
SMED30000003 p53
SMED30000004 tp1

我想A文件中的SMED的行在B中查询，如果查到的话，把第二列信息加进来，即结果如下，请问如何实现？
>SMED30000001 FTO
ATAAAATTTAACATTAATATAAGATTAAAATGTAGAATTACAATATTTTAGTTATGATAATAAGCATGATATTAATTAGA
>SMED30000002
TATTCGACTAGTTTTCAGTGGAAACAAGAATTTAACGAAGAGAAACATGCACAAAACTTTGTTCATTGCAGAAAGATCAG
TGCGTAGATGAATATATTAAGGTAACGC
>SMED30000003 p53
AATTTTTGTTAACATAATCAATAGTACAAGCATTAAGCATAATTATTATCAATATCCTAATTACACATCAATTTTTGTGA
CAATGACATGTCACATTGAGA
>SMED30000004 tp1
GCAAAGAAAATTCCCCTTTTTAATTGCAGCCTATAAAATAAAATTAGATCGCGATTTAATAGATATTTTTCCACAGAACT
CTTTCAAAGAATTTCTCTCAGAATATTCATGGCTACAAGTGTTGAAAGTGAAGAAGAATTTCAAGATTTTATTGATGGAA

谢谢大家！

文库|博客

chenjiali1

稍有积蓄

论坛徽章:: 0

2楼 [报告]

发表于 2019-06-21 10:12 |只看该作者

将一个文件中的字符按照另一个文件批量替换

大家好，我的A文件是这样的。
>SMED30000001
ATAAAATTTAACATTAATATAAGATTAAAATGTAGAATTACAATATTTTAGTTATGATAATAAGCATGATATTAATTAGA
>SMED30000002
TATTCGACTAGTTTTCAGTGGAAACAAGAATTTAACGAAGAGAAACATGCACAAAACTTTGTTCATTGCAGAAAGATCAG
TGCGTAGATGAATATATTAAGGTAACGC
>SMED30000003
AATTTTTGTTAACATAATCAATAGTACAAGCATTAAGCATAATTATTATCAATATCCTAATTACACATCAATTTTTGTGA
CAATGACATGTCACATTGAGA
>SMED30000004
GCAAAGAAAATTCCCCTTTTTAATTGCAGCCTATAAAATAAAATTAGATCGCGATTTAATAGATATTTTTCCACAGAACT
CTTTCAAAGAATTTCTCTCAGAATATTCATGGCTACAAGTGTTGAAAGTGAAGAAGAATTTCAAGATTTTATTGATGGAA

B文件是这样的
SMED30000001 FTO
SMED30000002
SMED30000003 p53
SMED30000004 tp1

我想A文件中的SMED的行在B中查询，如果查到的话，把第二列信息加进来，即结果如下，请问如何实现？
>SMED30000001 FTO
ATAAAATTTAACATTAATATAAGATTAAAATGTAGAATTACAATATTTTAGTTATGATAATAAGCATGATATTAATTAGA
>SMED30000002
TATTCGACTAGTTTTCAGTGGAAACAAGAATTTAACGAAGAGAAACATGCACAAAACTTTGTTCATTGCAGAAAGATCAG
TGCGTAGATGAATATATTAAGGTAACGC
>SMED30000003 p53
AATTTTTGTTAACATAATCAATAGTACAAGCATTAAGCATAATTATTATCAATATCCTAATTACACATCAATTTTTGTGA
CAATGACATGTCACATTGAGA
>SMED30000004 tp1
GCAAAGAAAATTCCCCTTTTTAATTGCAGCCTATAAAATAAAATTAGATCGCGATTTAATAGATATTTTTCCACAGAACT
CTTTCAAAGAATTTCTCTCAGAATATTCATGGCTACAAGTGTTGAAAGTGAAGAAGAATTTCAAGATTTTATTGATGGAA

谢谢大家！

实战分享：从技术角度谈机器学习入门| 【大话IT】RadonDB低门槛向MySQL集群下战书 | ChinaUnix打赏功能已上线！ | 新一代分布式关系型数据库RadonDB知多少？

wh7211

版主

论坛徽章:: 25

3楼 [报告]

发表于 2019-06-21 10:32 |只看该作者

回复 1# chenjiali1

awk 'FILENAME==ARGV[1]{a[">"$1]=$2;next}{$0=a[$1]?$0" "a[$1]:$0}1' B A

复制代码

实战分享：从技术角度谈机器学习入门| 【大话IT】RadonDB低门槛向MySQL集群下战书 | ChinaUnix打赏功能已上线！ | 新一代分布式关系型数据库RadonDB知多少？

csccyab

小富即安

论坛徽章:: 0

4楼 [报告]

发表于 2019-06-26 06:03 |只看该作者

本帖最后由 csccyab 于 2019-06-27 09:57 编辑

$ awk 'FNR==NR {a[$1]=$2; next} {print $0,a[substr($1,2)]}' B A
>SMED30000001 FTO
ATAAAATTTAACATTAATATAAGATTAAAATGTAGAATTACAATATTTTAGTTATGATAATAAGCATGATATTAATTAGA
>SMED30000002
TATTCGACTAGTTTTCAGTGGAAACAAGAATTTAACGAAGAGAAACATGCACAAAACTTTGTTCATTGCAGAAAGATCAG
TGCGTAGATGAATATATTAAGGTAACGC
>SMED30000003 p53
AATTTTTGTTAACATAATCAATAGTACAAGCATTAAGCATAATTATTATCAATATCCTAATTACACATCAATTTTTGTGA
CAATGACATGTCACATTGAGA
>SMED30000004 tp1
GCAAAGAAAATTCCCCTTTTTAATTGCAGCCTATAAAATAAAATTAGATCGCGATTTAATAGATATTTTTCCACAGAACT
CTTTCAAAGAATTTCTCTCAGAATATTCATGGCTACAAGTGTTGAAAGTGAAGAAGAATTTCAAGATTTTATTGATGGAA

实战分享：从技术角度谈机器学习入门| 【大话IT】RadonDB低门槛向MySQL集群下战书 | ChinaUnix打赏功能已上线！ | 新一代分布式关系型数据库RadonDB知多少？

返回列表

Chinaunix › 论坛 › 程序设计 › Shell › 将一个文件中的字符按照另一个文件批量替换

[文本处理] 将一个文件中的字符按照另一个文件批量替换 [复制链接]

将一个文件中的字符按照另一个文件批量替换