去除相互重叠数据

biobaby

各位大神好，我这里有一个文件是基因组的位置信息，现在想要去重，想要求助。文件格式如下：chr      position1  position2   name   pvalue

chr1    100    120    peak1   0.001
chr1     98      105   peak2   0.0001
chr1     115    139   peak3    0.004
chr1     120    140   peak4    0.01
chr1      34     55     peak5    0.002

去重规则为：首先按照pvalue 从显著到不显著排序，然后从第一个最显著的peak开始，只要后边有和他overlap的peak则把后边的peak丢弃。然后再看第二显著的peak,同理后边如果有overlap的则丢弃。

以此类推，最后得到，互斥的一组peak.
请问可以实现吗？谢谢大家

cfwyy

可以实现。

biobaby

回复 2# cfwyy

可以拜托帮忙写一下吗 谢谢

ll104567

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