mpich2下用ifort10编译nwchem5.1老是在最后link时出现某些“未定义”错误,试了下openmpi(版本1.2.6),似乎是成功了,没有严重的错误提示。一切先用默认模式安装openmpi。 Open-mpi的安装: 即 tar -xvzf openmpi-xxxx.gz cd openmpi-xxxx ./configure --prefix=/usr/local/openmpi | tee cfg.log & make all | tee make.log & make install | tee makeinstall.log & 末尾出现些subscripts too complex的...
by beyondstar - Linux文档专区 - 2009-06-15 12:58:05 阅读(1081) 回复(0)
本帖最后由 peticure 于 2012-11-02 14:58 编辑 各位,我是个初学者,面临一个集群的问题,经验不足求助大家,先谢谢各位。 Radhat 5.4 现在的环境是22台刀片服务器,每台都有Infiniband卡。其中10台服务器通过可以并行运算,后12台不能并行运算。使用的是openmpi-1.3.4。 以下是并行预算提示的错误: [root@hpcn1 ~]# mpirun -machinefile /etc/hosts.equiv /hpchome/icpi hpcn13.4787ipath_wait_for_device: The /dev/ipa...
用的fedora15, Installed Packages openmpi.i686 1.5-3.fc15 @Everything-ftp.sjtu.edu.cn openmpi-devel.i686 1.5-3.fc15 @Everything-ftp.sjtu.edu.cn 在编译软件的时候configure总是报一个错误: checking for MPI_Send in -lmpi... no checking for nc_open in -lnetcdf... no checking for the toolset name used by Boost for g++... configure: WARNING: could not ...
请教一下,用虚拟机如何模拟集群,怎样来进行配置呢,我是用集群来做并行运算,在openmpi环境下,网上见过一些用mpich配置集群的,但openmpi的很少见,请大家帮帮忙,新手,不要见笑,要学习openmpi哪里的资源多些呢,谢谢
想请教一下,用虚拟机如何模拟集群,怎样来进行配置呢,我是用集群来做并行运算,在openmpi环境下,网上见过一些用mpich配置集群的,但openmpi的很少见,请大家帮帮忙,新手,不要见笑,要学习openmpi哪里的资源多些呢,谢谢
目前我正在使用的计算中心是redhat ws3.0版本的LINUX,并且装备了10G的infiniband,但是非常郁闷的是很长时间都没有人在用infiniband导致目前对infiniband的使用技术失传。 由于进行量子化学计算,需要大量的并行计算资源,TCP/IP协议的延迟几乎让所有平行计算的人抓狂。所以打算把infiniband使用起来。初步查了一些资料,好像是正确配置infiniband需要一个叫OFED的软件,然后在编译openmpi(或者MVAPICH2,但是程序开发者说 OPEN...
1.如何在linux和windons两台pc机上连接,每台pc机上只有一个网卡,用oscar和openmpi? 2.用gt4如何在linux和windons两台pc机上连接,每台pc机上只有一个网卡
1.如何在linux和windons两台pc机上连接,每台pc机上只有一个网卡,用oscar和openmpi? 2.用gt4如何在linux和windons两台pc机上连接,每台pc机上只有一个网卡
自己把cluster编译了,很有收获,也很高兴,主要还是参照下面的。他总结的好的很,特地转过来。以后在学习之。 CentOS5.2+mkl 10.1.0.015+openmpi 1.3.2+ifort 11.0.074编译vasp5.2 安装编译环境: Cluster简况:xeon 5420, 12G ram, 千兆交换机。 CentOS5.2+mkl 10.1.0.015+openmpi 1.3.2+ifort 11.0.074 注:1, vasp作者在makefile里说用openmpi比用mpich2要更快。 2, 按网上的说法, 对于vasp4.6, 采用intel的ifc编译...