有没有办法，相同元素也作为不同元素处理？

huang6894

如题：
比如：
一般做匹配处理的时候，我们都是： awk -F"\t" 'NR==FNR{a[$3FS$2FS$4"/"$2]=$1;next}{if($1FS$2FS$3 in a){print a[$1FS$2FS$3]"\t"$0}}'  file1 file2
如果是下面的文本的话：
file1

1. 
   
2. 1   chr16   2121813  GACCAGCG        G       39.73   PASS
   
3. 2   chr16   2121863  GCAGGCCCCG      G       39.73   PASS
   
4. 3   chrX    70331316   GCACAA  G       39.73   PASS   
   
5. 4   chr16   2121813  GACCAGCG        G       39.73   PASS
   
6. 5   chrX    70331316   GCACAA  G       39.73   PASS
   
7. 6   chrX    70331316   GCACAA  G       39.73   PASS

复制代码

file2

1. 
   
2. GACCAGCG   2121813   G/chr16    HEHEHE1
   
3. GCAGGCCCCG 2121813   G/chr16    HEHEHE2
   
4. GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE2
   
5. GACCAGCG   2121813   G/chr16    HEHEHE3
   
6. GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE2
   
7. GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE4
   

复制代码

如果是上面的命令，应该是得到：

1. 
   
2. 1  GACCAGCG   2121813   G/chr16    HEHEHE1
   
3. 2  GCAGGCCCCG 2121813   G/chr16    HEHEHE2
   
4. 3  GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE2
   
5. 1  GACCAGCG   2121813   G/chr16    HEHEHE3
   
6. 3  GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE2
   
7. 3  GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE4
   

复制代码

可是我想得到的是：

1. 
   
2. 1  GACCAGCG   2121813   G/chr16    HEHEHE1
   
3. 2  GCAGGCCCCG 2121813   G/chr16    HEHEHE2
   
4. 3  GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE2
   
5. 4  GACCAGCG   2121813   G/chr16    HEHEHE3
   
6. 3  GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE2
   
7. 5  GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE4
   

复制代码

就是最后一列不同的，我想使用第二个编号。。。。可以吗？

谢谢大神们了~

Herowinter

回复 1# huang6894
表示没看懂需求，另外，
用你的代码和文本好像没任何输出。


   

li0924

1. awk 'NR==FNR{t=$4FS$3FS$5"/"$2;n=b[t]++;a[t,n]=$1;next}{i=$1FS$2FS$3;if(i in b){y=d[i]++;print a[i,y]FS$0}}'  file1 file2

复制代码

ly5066113

回复 1# huang6894


try:

1. awk -F '\t' 'NR==FNR{k=$4FS$3FS$5"/"$2;a[++b[k]k]=$1;next}{k=$1FS$2FS$3;if($NF!=c[k]){c[k]=$NF;d[k]++}if(d[k]k in a){print a[d[k]k]"\t"$0}}' file1 file2

复制代码

li0924

;----

jason680

回复 1# huang6894

$ awk -vs="," 'NR==FNR{k=$4s$3s"G/"$2;t=k","++c[k];a[t]=$1;next}{k=$1s$2s$3;if(x[k]==""){x[k]=$NF};t=x[k]==$NF?1:2;print a[k","t]"\t"$0}' file1 file2
1        GACCAGCG   2121813   G/chr16    HEHEHE1
        GCAGGCCCCG 2121813   G/chr16    HEHEHE2
3        GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE2
4        GACCAGCG   2121813   G/chr16    HEHEHE3
3        GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE2
5        GCACAA   70331316  G/chrX   HEHEHE4

Note: your file data can not match number 2
BTW, It's hard to know what you say   

huang6894

@Herowinter@jason680谢谢两位大神，额。。数据是我乱写的，有错也不奇怪，不好意思啊，给你们添麻烦了。
意思就是说，以一个文本的其中几列建立哈希去匹配另外的一个文本，如果第二个文本存在多行符合匹配，如果该行相同，输出相同的value，如果存在不同的话，输出不同的指向value。。。

huang6894

@li0924@li0924谢谢两位大神，我好好研究下

yestreenstars

1. $ awk 'NR==FNR{a[$4,++b[$4]]=$1;next}{if(!c[$1$4]++)d[$1$4]=++e[$1];print a[$1,d[$1$4]]"\t"$0}' a b
   
2. 1       GACCAGCG        2121813 G/chr16 HEHEHE1
   
3. 2       GCAGGCCCCG      2121813 G/chr16 HEHEHE2
   
4. 3       GCACAA  70331316        G/chrX  HEHEHE2
   
5. 4       GACCAGCG        2121813 G/chr16 HEHEHE3
   
6. 3       GCACAA  70331316        G/chrX  HEHEHE2
   
7. 5       GCACAA  70331316        G/chrX  HEHEHE4

复制代码

huang6894

回复 9# yestreenstars


    谢谢星辰大大