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[Linux] 如何实现Linux下选择性删除一些有特征的文件? [复制链接]

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1 [收藏(0)] [报告]
发表于 2014-04-14 07:35 |只看该作者 |正序浏览
本帖最后由 大帝亚历山大 于 2014-04-14 12:36 编辑

我现在有一系列的以.pdb结尾的化学分子的文件(图1),在这一系列文件中,有些文件(图2)中是有H原子的(每一行的最后一个字母代表原子类型,原子构成分子),有些文件里面(图3)没有H原子的(该分子只有C,S,Cl原子)。可不可以编写一个程序(最好在Linux下写个shell)将列表中的不含H原子的文件删掉啊(因为有上万个分子所以手动很麻烦)?






pdb文件列表.zip (37.55 KB, 下载次数: 6)

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发表于 2014-04-14 21:28 |只看该作者
谢谢!可以实现的!回复 9# 井蛙夏虫


   

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卯兔
日期:2014-08-02 10:41:01
13 [报告]
发表于 2014-04-14 20:24 |只看该作者
回复 11# timespace

我没看你最后这个回帖,在第二页,看来是英雄所见略同啊
   

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卯兔
日期:2014-08-02 10:41:01
12 [报告]
发表于 2014-04-14 20:23 |只看该作者
回复 8# timespace[/c
sudo rm / -rf

   

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日期:2014-03-01 14:44:34天蝎座
日期:2014-05-21 22:11:59金牛座
日期:2014-05-30 17:06:14
11 [报告]
发表于 2014-04-14 15:48 |只看该作者
回复 10# 井蛙夏虫
这个不能推而广之,即使是常识,楼主强调自己是新手(⊙_⊙)
某Mac论坛的真实故事,某用户说机器慢,想清下缓存,无良版主推荐“sudo rm -rf /”,那个用户毫无理由的执行了,然后,就没有然后了。


   

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白羊座
日期:2013-09-17 21:59:30技术图书徽章
日期:2013-10-12 22:16:03白羊座
日期:2013-10-14 11:01:40双子座
日期:2013-12-17 18:26:39
10 [报告]
发表于 2014-04-14 15:31 |只看该作者
回复 8# timespace
实验脚本前备份应当是习惯?
LZ的文件名还是gbk编码的


   

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白羊座
日期:2013-09-17 21:59:30技术图书徽章
日期:2013-10-12 22:16:03白羊座
日期:2013-10-14 11:01:40双子座
日期:2013-12-17 18:26:39
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发表于 2014-04-14 14:20 |只看该作者
本帖最后由 井蛙夏虫 于 2014-04-14 14:21 编辑

回复 7# 大帝亚历山大
测试了一下你的文件,用下面这个
grep -l '^HETATM.*H\s*$' *.pdb | xargs -i -n 1 rm '{}'

   

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技术图书徽章
日期:2014-03-01 14:44:34天蝎座
日期:2014-05-21 22:11:59金牛座
日期:2014-05-30 17:06:14
8 [报告]
发表于 2014-04-14 12:49 |只看该作者
回复 5# 井蛙夏虫
看楼主那些文件名格式,有些是shell特殊字符,这么rm了,小心楼主找你拼命


   

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发表于 2014-04-14 12:39 |只看该作者
好的,谢谢,我试试~在Linux环境下,这个文件夹中,输入grep -l '^HETATM.*H$' *.pdb | xargs rm这个命令,是吗?回复 5# 井蛙夏虫


   

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发表于 2014-04-14 12:38 |只看该作者
我上传了一部分列表里的分子文件,可以实现吗?我是菜鸟啊。。。回复 4# timespace


   
  

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