两文件中指定列的搜索

李满满

学生党:无聊~用python模拟awk试试

1. 
   
2. #!/usr/bin/env python
   
3. # -*- coding:gbk -*-
   
4. 
   
5. import sys
   
6. import fileinput
   
7. list={}
   
8. for x in fileinput.input(sys.argv[1:]):
   
9.         if fileinput.lineno()==fileinput.filelineno():
   
10.                 list[(x.split()[0],x.split()[2],''.join(x.split()[6:10]))]=x
    
11.         else:
    
12.                 if (x.split()[0], x.split()[2],''.join(x.split()[6:10])) in list.keys():
    
13.                         print x,
    

复制代码

测试:
$ ./yhsafe.py file2.txt file1.txt
chr5   145237        A        3        10        30.10        [0, 0, 0, 10]     -        0.00         1.0
chr8   1555522       C        7        10        31.60        [10, 0, 0, 0]     -        0.00         1.0