2016-08-19

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  freesiaSS 发表了新话题 2016-08-19 14:23

  本地blast bioperl
  我想用bioperl 本地blast, 配置了~/.bashrc BLASTDB=/usr/local/Cellar/blast/2.4.0/db 设置了环境变量 $ export PATH=$PATH:/usr/local/Cellar/blast/2.4. ...

2016-08-03

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  freesiaSS 发表了新话题 2016-08-03 09:12

  匹配替换单词之间的空格
  仅匹配特定单词之间的空格， 比如，将 Lej flava Aej cavifo Dej sjua 替换成 Lej_flava Aej_cavifo Dej_sjua 有没有什么简便的方法。

2016-08-02

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  freesiaSS 发表了新话题 2016-08-02 09:52

  串联序列，不存在，打印gap长度
  我有一个文件（TEXT）简化如下： >taxon1 gene2 ———————gene2ATGAA1NNNNNNNNNN >taxon1 gene3 ——————gene3ACAAATTGGCTGGA---GCTGAAGAGCTATTGAA ...

2016-07-27

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  freesiaSS 发表了新话题 2016-07-27 17:12

  怎样分隔csv文件
  my $csv1 = 'atp1 CDS,CDS,"92,220","93,761","1,542",3,forward'; my $csv2 = 'atp1 exon 2,exon,"93,209","93,269",61,1,forward'; 将上述两 ...

2016-06-05

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  freesiaSS 发表了新话题 2016-06-05 11:14

  将匹配字符串的特定区段序列变成小写
  open(FILE1, "