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从lam/mpi到mpich的转换中的问题 [复制链接]

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发表于 2007-04-02 12:59 |只看该作者 |倒序浏览
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并行fortran90(固定格式)程序,在lam集群上,以lahey fortran编译器编译,没有任何问题。现需要在mpich集群上运行,并以intel fortran编译器编译。于是问题来了:

一共有4个子程序:每个编译都没问题,生成了相应的 .o 文件,最后用命令:

mpif90 -o 3dz *.o

3dz 为生成可执行程序名

进行连接时显示:

[yb]$ mpif90 -test -o 3dz *.o
ifort: Command line warning: ignoring unknown option '-test'
/usr/local/mpich/1.2.6..13a/gm-2.1.3nks4smp/smp/intel32/ssh/lib/libmpich.a(gmpi_conf.o)(.text+0x154f): In function `gmpi_getconf':
: undefined reference to `_intel_fast_memcmp'
/usr/local/mpich/1.2.6..13a/gm-2.1.3nks4smp/smp/intel32/ssh/lib/libmpich.a(gmpi_conf.o)(.text+0x15b4): In function `gmpi_getconf':
: undefined reference to `_intel_fast_memcmp'

我想,lam和mpich都是mpi的实现,语法上应该没什么特别的吧。不知道是不是intel编译器的问题。
请高手们指教。

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发表于 2007-04-02 15:35 |只看该作者
先export CFLAGS='-L/MPI_LIB_PLACE'
这是编译C语言时候的环境变量,我估计编译fortran程序也有类似的参数,你自己找找看吧。
把MPI_LIB_PLACE 改成相应的位置
然后在编译试试看。
我的系统上(fedora core 5)只有mpif77 没有mpif90 ,没法实验

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巳蛇
日期:2013-08-28 09:26:15CU十二周年纪念徽章
日期:2013-10-24 15:41:34射手座
日期:2013-10-31 09:13:04射手座
日期:2014-02-11 13:18:34天秤座
日期:2014-03-25 09:22:28
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发表于 2007-04-02 16:04 |只看该作者
你是用ssh来登录每个节点儿的?节点间的ssh不要密码连接都正常吗?

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发表于 2007-04-03 18:28 |只看该作者
原帖由 我爱钓鱼 于 2007-4-2 16:04 发表于 3楼  
你是用ssh来登录每个节点儿的?节点间的ssh不要密码连接都正常吗?



做好对等之后,passphase都emtpy,就不需要了. 默认platform/rocks作出来都是ssh connection.
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